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黄颡鱼是我国常见的中小型经济鱼类,其肉质细嫩,味道鲜美,营养价值高,备受广大消费者青睐。黄颡鱼的生长呈现显著的性别差异性,雄性黄颡鱼比雌性黄颡鱼生长速度快,体型大。鉴于此,我国的水产养殖业正大力开展黄颡鱼的单性育种养殖研究。本文采用ISSR和TRAP标记技术对黄颡鱼群体遗传结构和遗传多样性进行研究,为黄颡鱼种质资源保护及管理提供相关的遗传背景资料和理论依据。同时,应用ISSR和TRAP标记技术筛选与黄颡鱼性别决定相关的分子标记,为加强黄颡鱼单性育种的选择性定位,提高人工养殖的可预见性提供科学依据。本研究的主要工作和结论如下所述：1.黄颡鱼群体遗传结构的ISSR分析。应用ISSR标记技术对黄颡鱼2个野生群体(松花江群体,SH；黑龙江群体,HL)和2个养殖群体(肇东群体,ZD)辽阳群体,LY)的遗传多样性进行了分析,结果表明黄颡鱼4个群体遗传多样性水平较高,其中以SH最高,HL和ZD次之,LY最低,野生群体的遗传多样性水平高于养殖群体。遗传变异分析结果揭示黄颡鱼4个群体存在一定的分化,其中野生群体和养殖群体分化明显。2.黄颡鱼群体遗传结构的TRAP分析。应用TRAP标记技术对黄颡鱼野生群体(SH)和养殖群体(ZD)进行了遗传多样性分析。结果表明黄颡鱼2个群体的遗传多样性水平较高,SH的遗传多样性水平高于ZD。遗传变异分析结果表明SH和ZD存在一定分化。同ISSR标记检测结果比较,2种标记结果一致揭示黄颡鱼群体(SII、ZD)具有较高的遗传多样性,根据2种标记所得遗传距离构建个体进化树,得到了相似的聚类图,说明2种标记方法在黄颡鱼遗传结构研究均具有实用性和可操作性。从信息量上比较,TRAP的MI值(4.51)明显高于ISSR(2.42),表明TRAP标记具有更高的标记效率和遗传多样性检测能力。3.黄颡鱼性别特异分子标记的ISSR和TRAP筛选。本研究应用ISSR和TRAP标记技术对ZD黄颡鱼性别特异性标记进行筛选。应用ISSR技术获得2个雌性黄颡鱼特异性标记：UBC835-3位点,在雌性黄颡鱼中表达量为93.33%,在雄性黄颡鱼中表达量为13.33%；UBC835-4位点,在雌性黄颡鱼中的表达量为100%,在雄性群体中为0。应用TRAP技术获得2个雄性黄颡鱼特异性标记：ME1-EM1-22位点和ME2-EM3-8位点在雌性黄颡鱼表达量为40%,在雄性黄颡鱼表达量为100%,所以,可将这4个位点作为黄颡鱼性别鉴定的特异性分子标记。