【摘 要】
：
研究背景:心力衰竭是常见心血管病,诊断主要以症状,心脏超声及BNP结果为依据,但是上述方法有一定的局现性。目前缺少与心衰病理生理机制直接相关的生物标记物的研究,有关心衰风险预测模型的研究缺少外部验证。有关N6-腺嘌呤核苷酸甲基化修饰（m6A）在心力衰竭风险预测上的价值研究不足。研究目的:利用生物信息学方法结合转录后表观修饰特征联合分析筛选出心力衰竭分子标记物,进行风险预测模型的建立提升心衰诊断的准
论文部分内容阅读
研究背景:心力衰竭是常见心血管病,诊断主要以症状,心脏超声及BNP结果为依据,但是上述方法有一定的局现性。目前缺少与心衰病理生理机制直接相关的生物标记物的研究,有关心衰风险预测模型的研究缺少外部验证。有关N6-腺嘌呤核苷酸甲基化修饰（m6A）在心力衰竭风险预测上的价值研究不足。研究目的:利用生物信息学方法结合转录后表观修饰特征联合分析筛选出心力衰竭分子标记物,进行风险预测模型的建立提升心衰诊断的准确性。对于模型纳入的分子标记物进行功能分析。研究方法:本研究选取GSE5406芯片基因表达谱进行心衰与正常组织内差异基因选取,利用共识聚类对23种m6A调节因子进行表达模式鉴定,利用加权共表达基因网络的构建,鉴别出与疾病表型相关的基因模块。对基因模块结合m6A调节因子表达模式进行核心基因的筛选,利用LASSO回归进行变量筛选并进行模型构建。随后对于模型在GSE161472进行外部验证,利用x Cell对于样本进行免疫浸润分析。研究结果:在心衰组织与正常组织之间存在1951个差异基因,共识聚类鉴别出了4种m6A调节因子表达模式,利用加权基因共表达网络构建筛选出61个核心基因,利用LASSO回归筛选出HSPB1,HMOX2,HSP90AA1,LTBP1,RPLP0进行风险与测模型建立,模型区分力为AUC:0.992,验证集中的AUC:0.802（心室）,0.548（心房）,免疫浸润分析表明模型内生物标记物与免疫细胞浸润相关。研究结论:HSP90AA1,HMOX2,HSPB1,LTBP1以及RPLP0具有作为诊断用生物标记物的潜力并且受到m6A修饰,上述分子建立的心衰风险预测模型在训练集以及验证集具有良好区分度,并上述生物标记物与心衰相关免疫微环境的构成有关。
其他文献
目的:哺乳动物生殖细胞发育是一个极其复杂且精细的程序。在正常情况下,哺乳动物生殖细胞特别是卵母细胞的发育过程主要包括配子发生,转移,受精和宫内发育。在此过程中,任何异常都可能影响个体的生殖能力,并导致不孕不育。卵母细胞发育和成熟是影响胚胎健康的关键步骤。当卵母细胞生长到成熟体积的80%时,它就获得了恢复减数分裂的能力。此时,卵母细胞核大,染色质高度疏松并且核膜完整,称为生发泡（germinal v
目的:研究TMPRSS4在各个病理类型的卵巢上皮性肿瘤组织中表达的差异,意义在于发现TMPRSS4与卵巢上皮性肿瘤之间的关系,指导卵巢上皮性恶性肿瘤的诊断、治疗及预后评估。研究方法:收集卵巢上皮细胞肿瘤病例资料70例,根据其病理类型分为三组,其中卵巢恶性肿瘤30例、卵巢交界性肿瘤20例、卵巢良性肿瘤20例,而后应用免疫组织化学方法对其染色,观察TMPRSS4在各卵巢上皮性肿瘤组织中的表达情况以及与
目的:通过网络药理学的方法探讨丹参-川芎治疗视网膜中央静脉阻塞的作用机制。方法:在TCMSP数据库查找丹参、川芎的有效成分,进一步查询作用的靶点。通过Uniprot数据库检索丹参-川芎有效靶点的基因名。通过多种疾病数据库搜索得到视网膜中央静脉阻塞的相关基因名称。在线绘制丹参-川芎靶点基因和视网膜中央静脉阻塞疾病基因的Venn图,获取交集基因名。应用Cytoscape软件3.8.2版本,绘制丹参川芎
目的:本研究通过制备还原氧化石墨烯/壳聚糖/丝素蛋白纳米复合材料支架（r GO/CS/SF）,探究其物理及化学性能,及不同材料组成对支架是否产生及产生何样影响;通过在细菌实验中加入不同组别的支架材料,考察其抗菌及抑菌性能;通过体内实验,探究不同组别的支架材料对成骨的影响及作用机制,为临床合理应用还原氧化石墨烯支架材料提供理论基础和实验依据,同时为临床治疗骨缺损疾病提供新的思路。方法:本实验通过热还
为了有效应对新冠肺炎疫情冲击,推动苹果产业稳定健康发展,产业经济研究室基于987名苹果相产业者的调研数据,从生产、储藏和销售环节系统分析新冠肺炎疫情对苹果产业发展的影响。研究表明:在苹果生产环节对农资、劳动力、苗木供给和果园管理影响较大;在储藏环节涉果企业复工难,贮藏苹果出库率较去年同期大幅下降,贮藏企业、果农面临亏损风险;在苹果销售环节终端市场消费低迷、价格呈低走态势。
目的:目前局部晚期直肠癌（LARC）的标准治疗方法是新辅助放化疗（NCRT）后全肠系膜切除术（TME）。与术后放化疗相比,NCRT可改善患者预后。本研究通过Meta分析比较新辅助治疗后立即或延迟手术的优缺点。研究方法:系统检索Pub Med、Embase、Cochrane Library、Web of Science等数据库,检索时间截止至2021年10月,相关文献依据纳入和排除标准,以系统综述和
目的:褪黑素被认为是一种有效的抗癌剂。细胞套叠（Cell In Cell,CIC）结构通过改变肿瘤细胞能量代谢在恶性肿瘤的发展中发挥作用。本研究拟开发一种负载褪黑素的3D打印镁-聚己内酯（Mg-Polycaprolactone,Mg-PCL）支架,并研究了其对骨肉瘤（Osteosarcoma,OS）中CIC的影响机制。通过3D打印制备Mg-PCL支架并确定其特性。在体内和体外研究该支架以及负载褪黑
目的:近几十年来,对癌症的研究一直是科学研究的焦点。然而,癌症的发生与发展是一个综合的过程,一些致癌基因在多种癌症中发挥作用。因此,对癌基因进行泛癌表达分析,验证其与临床预后的对应关系及潜在的分子机制非常关键。本文对DNA损伤反应的核心分子CHK2进行泛癌的癌与正常组织基因及蛋白表达差异、与生存预后及病理分期关系、基因突变以及富集分析,并探讨其与各种免疫生物标志物之间的关联。阐明CHK2在不同癌症
目的:探讨可诱导T细胞共刺激分子（Inducible T-cell co-stimulator,ICOS）在卵巢上皮性肿瘤中的表达情况及与卵巢恶性上皮性肿瘤临床病理特征的相关性,为卵巢上皮性肿瘤诊断与治疗提供新方向。研究方法:用于研究的70例样本来自2010年1月至2020年12月期间在中国医科大学附属第四医院经手术治疗的卵巢肿瘤的石蜡包埋组织,术后经组织病理学证实为卵巢上皮性肿瘤,所有患者术前均