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鹿前后盘吸虫（Paramphistomum cervi）、中华歧腔吸虫（Dicrocoelium chinensis）及矛形歧腔吸虫（Dicrocoelium dendriticum）是寄生于反刍动物的三种寄生虫，前者隶属于棘口目前后盘科，后两者隶属于斜睾目歧腔科。三种吸虫感染均可导致严重的动物吸虫病，值得关注的是这三种吸虫亦能寄生于人体肝脏胆管和胆囊使人致病，至今已有美国、韩国、日本等国报道人类感染病例。所以要想积极有效的防治并消灭这三种寄生吸虫的感染，就要深入的了解它们的种系遗传特征，在此基础上更进一步的去探究它们的遗传模式、生态特征、以及抗药性的产生等。因此，本研究在三种吸虫的分子分类、群体遗传研究、疾病特异性诊断和防控、保障人类的健康以及社会公共卫生方面具有重要的意义。1．测定和分析了不同地域来源的鹿前后盘吸虫、中华歧腔吸虫及矛形歧腔吸虫虫株介于18S和28S核糖体rDNA基因之间的转录间隔区（ITS）序列。三种吸虫的长度分别为854bp～868bp，955bp～960bp和1140bp～1144bp，种内变异率分别为0～2.475%，0～2.5%和0～0.62%。基于ITS序列信息进行种系发育分析，各个种的吸虫聚集到一起，中华歧腔吸虫和矛形歧腔吸虫的亲缘关系与卫氏并殖吸虫最近，其次为日本血吸虫、华枝睾吸虫和麝猫后睾吸虫，而与肝片形吸虫亲缘关系较远，与鹿前后盘吸虫关系最远。2．应用PCR和DNA序列分析方法，对鹿前后盘吸虫（甘肃和四川分离株）和中华歧腔吸虫（甘肃和四川分离株）线粒体DNA（mtDNA）中的两个基因片段，即细胞色素c氧化酶亚基I（cox1）基因和烟酰胺脱氢酶亚基I（nad1）基因进行了多态性分析。鹿前后盘吸虫pcox1和pnad1片段大小分别为399bp和532bp，种内变异率为0～15.4%(pcox1)和0～8.4%（pnad1），种间变异率为21.8%～27.3%（pcox1）和25.6%～32.4%（pnad1）。中华歧腔吸虫pcox1和pnad1片段大小分别为358bp和458bp，种内变异率为0～0.84%和0～0.87%，种间变异率为22.9%～29.3%和33.6%～41.5%。种系发育树显示，中华歧腔吸虫与日本血吸虫的亲缘关系最近，其次是卫氏并殖吸虫、华枝睾吸虫和麝猫后睾吸虫，距离最远的是肝片形吸虫；鹿前后盘吸虫和华枝睾吸虫、麝猫后睾吸虫亲缘关系最近，其次为卫氏并殖吸虫和肝片形吸虫，与日本血吸虫亲缘关系最远；从种系发育树可见，鹿前后盘吸虫样品中很有可能含有隐藏种。3．以鹿前后盘吸虫和中华歧腔吸虫及矛形歧腔吸虫作为研究对象，首次获得了三种吸虫全基因组序列。三种吸虫线粒体基因组序列全长分别为14014bp，14910bp，14884bp，全基因组共有36个基因组成，分别为12个蛋白质基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因组成，基因排列顺序与已报道的肝片形吸虫，卫氏并殖吸虫一致。将其与其他已报道的吸虫构建种系发育树。结果显示，鹿前后盘吸虫与肝片吸虫、卫氏并殖吸虫等亲缘关系较近，与血吸虫类较远。中华歧腔吸虫及矛形歧腔吸虫与华枝睾吸虫、毛后睾吸虫、肝片吸虫、卫氏并殖吸虫亲缘关系较近，与血吸虫类亲缘关系较远。4．此实验获得了三种吸虫ITS rDNA序列并首次获得了鹿前后盘吸虫、中华歧腔吸虫的pcox1和pnad1序列以及三种吸虫的全基因组序列。研究结果较为全面的反映了我国三种吸虫的遗传变异情况，建立了鹿前后盘吸虫、中华歧腔吸虫及矛形歧腔吸虫种特异性PCR鉴定方法，通过对三种结果的对比显示ITS rDNA和线粒体基因组序列都可以应用在寄生虫的遗传变异。研究结果具有重要的学术价值，并为有效防控前后盘吸虫病和歧腔吸虫病提供了参考资料。