大白菜SRAP遗传图谱构建及抗软腐菌(Ecc-1-1)的QTL分析

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本研究将大白菜高抗软腐病自交系A32-2和高感软腐病自交系A19-2进行杂交,用获得的F2代225个单株作为构建遗传图谱的作图群体,通过SRAP分子标记方法的遗传分析,构建了大白菜抗软腐病分子遗传图谱;并进行了与大白菜抗软腐病性状有关的QTL定位。为建立大白菜软腐病抗性育种分子标记辅助选择系统奠定基础。研究结果表明:1.本试验采用大白菜软腐病快速鉴定方法,对亲本A32-2、A19-2、F1及F2代进行抗病接种鉴定分析。经鉴定表明,两亲本间抗、感差异明显,母本均表现抗病,父本均表现感病:F1表现抗病;F2代抗性分离,其中0级21株,1级60株,3级75株,5级43株,7级16株,9级10株,共225株。根据F2代病情分级和各病级的株数制作了二维分布图及利用SAS8.2 univariate程序进行偏度、峰度检验,偏度参数为0.8484,峰度参数为0.1358。说明病情株数呈正态分布,符合数量性状特点。2.本试验对SRAP-PCR反应条件进行了优化,建立了一套适合于本试验的反应条件,对Mg2+、dNTP、Taq酶、引物、模板DNA分别做了浓度梯度试验,最后确定总体积25μl的优化反应体系为:Mg2+浓度3.0mmol/L、dNTP浓度0.3mmol/L、Taq酶1.5U、引物浓度0.2μmol/L、模板DNA60ng。3.通过对F2群体SRAP分析,得到了139个SRAP多态性位点,经Mapmaker/EXP3.0软件处理,构建了包含10个连锁群,由103个遗传标记组成的大白菜抗软腐病分子遗传图谱。该图谱覆盖长度为1223.6cM,平均图距11.9 cM。每个连锁群上的标记数在4~25之间,标记间最大间距为33.1cM,最小间距为2.2cM,连锁群长度在40.5~348.0 cM之间。4.进行F2代分子标记,采用Mapmaker3.0软件进行分析,以最大图距50cM作为划分连锁群和排列markers的基准距离。并用WINQTLCart2.5进行作图,采用复合区间作图法,共检测到4个大白菜软腐病抗性基因的QTLs位点。QE1,QE2位于第2连锁群上,加性效应分别为9.17和10.56,可以解释的表型变异分别为14.23%和22.73%;QE3位于第6连锁群上,加性效应为5.24,可以解释的表型变异为9.33%;QE4位于第7连锁群上,加性效应为4.35,可以解释的表型变异为8.52%。实验结果表明,大白菜软腐病Ecc-1-1抗性为连续分布且4个QTLs位点不能解释Ecc-1-1全部的表型变异,说明大白菜抗Ecc-1-1株系的抗性为不完全显性,受多对基因控制,支持数量性状基因控制Ecc-1-1抗性的观点。
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