【摘 要】
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2019年12月新型冠状病毒在中国武汉爆发,而后迅速扩散至全球,引起国内外高度关注。截止本论文完成之际,国内外对该病毒的防治仍然缺乏有效的手段。因此,冠状病毒方面的研究,特别是基础研究仍需继续加强。本研究通过对病毒基因组等数据的综合分析,为新冠病毒以及今后可能爆发的其他冠状病毒的防治提供理论依据,也为冠状病毒,乃至整个套式病毒目的基础研究提供新的方向和思路。申请人在本研究中拟解决两个关键科学问题:
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2019年12月新型冠状病毒在中国武汉爆发,而后迅速扩散至全球,引起国内外高度关注。截止本论文完成之际,国内外对该病毒的防治仍然缺乏有效的手段。因此,冠状病毒方面的研究,特别是基础研究仍需继续加强。本研究通过对病毒基因组等数据的综合分析,为新冠病毒以及今后可能爆发的其他冠状病毒的防治提供理论依据,也为冠状病毒,乃至整个套式病毒目的基础研究提供新的方向和思路。申请人在本研究中拟解决两个关键科学问题:（1）新冠病毒主要的基因组特征及其在传播和爆发中的作用;（2）新冠病毒跳跃式转录的调控区域与基因组重组区域在核酸序列上是否具有相似性。本研究的结论和主要贡献:（1）导致冠状病毒强大的跨物种传播能力、广泛的宿主适应性以及反复爆发的最根本因素是重组;（2）冠状病毒的跳跃式转录和基因组重组具有相同的分子机制,其爆发不可避免;（3）单一因素的优化不足以导致冠状病毒大爆发,只有通过重组,使不同病毒株中的已优化的单一因素组合到一起,才能产生传播能力强、宿主适应性广泛的超级病毒株;（4）没有增强型ORF8基因的WIV1病毒株和S1/S2交界处没有Furin蛋白酶切位点的Ra TG13病毒株可能分别促成了严重急性呼吸综合征病毒和新冠病毒,但不是它们的直接祖先,穿山甲并非新冠病毒的中间宿主;（5）在国际上首次确认了全部冠状（甚至整个套式病毒目）病毒的TRS基序都是以核苷酸A开始长度为6-8 bp的核酸序列,冠状病毒的重组区域的也是以核苷酸A为开始的核酸序列,彻底解决了冠状病毒TRS基序与重组区域的鉴定难题;（6）重新鉴定了全部冠状病毒的TRS基序;（7）确认了ORF基因在SARS-Co V和SARS-Co V-2方式相同,为SARS-Co V和SARS-Co V-2溯源奠定了基础。
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