蛋白质组学研究是基因组学研究的重要补充和延伸,蛋白质组与基因组研究相结合将更有助于阐明细胞整体功能。血浆蛋白质组是人类蛋白质组计划的核心内容,越来越受到人们的关注。血浆中蕴含着生命机体的所有信息,只有彻底了解血浆中的蛋白质种类,才能利用血浆来预测人体对疾病的易感度并监控疾病的进程,达到对疾病进行早诊断早治疗的目的。目前,血浆蛋白质组学以二维电泳-质谱(2-DE-MS)为核心分离鉴定技术。但血浆蛋白的复杂性和高丰度蛋白的存在使血浆蛋白质组学的研究受到很大限制。因此,有必要对样品进行预处理以提高2-DE对低丰度蛋白的检测灵敏度和质谱鉴定的可靠性。本文特别针对芯片自由流电泳等电聚焦方法去除血浆中高丰度蛋白进行了研究。本文在原有实验的基础上对芯片自由流电泳系统进行了改进,制作了一种凝胶隔离型微流控自由流电泳芯片,用3M双面胶封合芯片,同时搭建分离通道,简单易行。琼脂糖凝胶可有效将分离室和电极池隔开,避免了电解产物对分析过程的干扰。使用载体两性电解质在分离室内建立了线性的pH梯度,以荧光染料和酸碱指示剂为探针,用直接成像法对形成的pH梯度进行了表征。在等电聚焦电泳分离模式下,成功实现了牛血红蛋白和细胞色素C两种蛋白质的聚焦分离。将该方法用于去除人血浆中的高丰度蛋白,并用SDS-PAGE凝胶电泳测定,结果表明该方法可有效去除血浆中的白蛋白,同时实现了血浆低丰度蛋白的浓缩富集。本文最后对在微流控芯片分离通道内建立整体材料固定化pH梯度进行了探索研究,原位聚合了具有通透性的整体材料,初步结果表明该方法具有可行性。该芯片自由流电泳系统特别适合少量复杂生物样品中蛋白质组分的快速等电聚焦制备分离,作为复杂蛋白样品的分析鉴定预分离方法,在蛋白质组及临床病理样品的快速分析中将有广泛应用。