流域内生态补偿模式的建立是解决流域上下游之间各行政区域之间生态环境保护的重要的经济手段,有助于改善流域上游与下游之间的区域经济不协调以及消耗水资源矛盾突出的现状,对于实现流域内整体的水资源平衡和水资源的可持续绿色发展有着重要意义。新安江作为安徽省和浙江省的主要河流,对于两省的社会经济发展提供着重要的保障。但是由于近年来国内经济的快速发展,各省市间引入大量企业以及国内外资本,城镇化的脚步不断加快,人们对于水资源的大量使用以及对于生产生活中向流域内排放废水,垃圾等。导致新安江流域内的水资源环境有所变差。对于此种状况,本研究根据新安江流域整体的生态保护研究所存在的问题,并根据国内外流域生态补偿的研究成果的基础上,运用生态系统服务价值法,费用分析法,水质处理成本法三种方法,对于新安江流域进行生态补偿核算,科学有效的建立在新安江流域生态补偿标准的精准测算对于维护整个新安江流域生态系统的稳定具有重大意义。论文以新安江流域（安徽段）为主要研究区域,主要研究结果如下如下:（1）新安江流域上游地区水质及河岸周边地区CODMn、NH4-N、BOD5和TP等污染物浓度处于浮动下降的趋势;流域内氮磷负荷主要来源于新安江流域的农业源,生活源其次,工业源最少。（2）在2011年-2020年十年间新安江流域的土地利用结构发生较为显著的变化,耕地面积总量增加2.41%,湿地面积总量增加0.39%,林地面积下降总量高达2.94%。2011-2015年的土地利用矩阵与的转移方向与2015-2020年的土地利用矩阵的转移方向都主要为耕地和城镇用地转化为林地、草地、湿地;（3）生态服务价值法通过对流域内四大类功能9项服务指标的计算得到研究区生态服务价值总量为277.08亿元;（4）基于费用分析法通过统计以及动态核算得到折算后的直接成本为15.7028亿元,分别通过2种对比参照法得到发展损失的机会成本为11.7666亿元,则后续年份流域上游每年需要投入27.4694亿元的资金用于生态环境资源保护以及相关人员补贴等;（5）基于水质处理成本法,通过模拟设计污染物（氮磷）被区域内污水处理厂全部处理,得出水质处理成本为26.7768亿元;由于通过生态服务价值法测算较高,在实际的操作过程中难以实现,可作为生态补偿上限,所以本文以水质处理成本测算的生态补偿标准26.7768亿元作为新安江流域生态补偿标准的下限进行省级补偿。