随着我国经济体制和工程建设承发包制度的改革,工程索赔得到越来越多的重视。但由于工程索赔的概念在我国出现时间较晚,尚处于发展阶段,相应的配套政策和体制还不是很完善,而且参与工程建设的各方对于工程索赔的认识还不是很全面,缺乏一定的理论知识和实际经验,因此我国的工程索赔管理还存在很多的不足。本论文主要是在分析国内外索赔现状的基础上,针对施工企业索赔组织系统进行分析和研究,并且对新出台的08清单计价规范下施工企业索赔方法也进行了探索和研究。论文的主要内容和创新点如下：(1)索赔工作管理体系主要是针对施工索赔的具体操作,该体系由索赔机会识别、提出索赔、收集索赔证据、索赔处理、总结备案等五部分组成,经过分析,又分为索赔机会识别、索赔处理、总结备案等三个部分进行了分析总结,得出施工索赔处理程序图、索赔争端解决办法及其优缺点等等。(2)通过建立索赔组织机构决策博弈模型,并对模型进行分析,得出施工企业和业主的占优战略均为建立索赔组织机构。(3)分析总结了索赔组织机构设立的影响因素和组建原则,并在此基础上总结了小型施工企业在企业总部无需设立专门的索赔职能部门,只需根据项目规模建立项目索赔管理机构,并分析总结出中、小型工程项目采用直线职能式索赔管理组织机构；另外,给出了大型施工企业总部的矩阵式索赔组织机构,以及在不同规模下的项目索赔组织机构,主要针对大型工程建立了矩阵式索赔组织结构模式。并且分析总结了各模式的优缺点。(4)分析总结出索赔人员的设置以及对索赔人员的综合素质要求,并对索赔工作保证体系进行了探索性的研究。(5)总结出08清单计价规范与03清单计价规范的区别,并对08计价规范对工程索赔方法的影响进行了探索和研究。