利用选择信号分析方法筛选与绵羊尾型相关的基因

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guangmingkoxiuluo
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
我国的养羊历史悠久,绵羊品种资源丰富,但产量相对落后,绵羊的产量、羊肉的质量关乎农牧民的经济收入、人们对羊肉的需求。人们对心脑血管疾病的关注,绵羊的尾部脂肪逐渐失去了市场价值和经济价值。按照绵羊的尾型,至少可以把绵羊分为四类,瘦尾、脂臀尾、短脂尾和长脂尾。野生绵羊是瘦尾羊的事实,表明不同尾型的绵羊是在人们畜牧生产中特意选育的结果。生物技术的发展和统计学方法的提出,使得我们能够检测这种选择在基因组上留下的信息,进而挖掘出与绵羊尾型有关的基因,为绵羊的品种选育和种质资源的保存利用提供依据。此次研究,选择具有极端表型的两个类群,即:肥尾、瘦尾共计122个个体进行50K基因芯片分型。在进行选择信号分析之前,我们首先用NETVIEW方法构建我国11个品种绵羊的精细图谱,以了解我国绵羊的群体遗传结构。NETVIEW分析的结果表明我国的绵羊可以分为两个大的类群,一类是藏系绵羊;另一类是蒙古-哈萨克系;乌珠穆沁羊与除罗布羊以外的蒙古系绵羊均有直接遗传关系,与罗布羊有间接的遗传关系。罗布羊与哈萨克系绵羊有较近的遗传关系,而哈萨克系的哈萨克羊与多浪羊存在较远的遗传关系。迪庆羊能够与藏系绵羊分离开,西藏地区藏羊能够与其它地区的藏羊分开,青海、四川的藏羊不能分开;NETVIEW分析群体遗传结构的计算时间短,与PCA、NJ树、STRUCTURE的结果大体一致,且基本能够反映史实,因而可以作为未来群体结构分析的工具;乌珠穆沁羊是此次试验的蒙古系绵羊中,最古老的一个品种;不同地区的藏羊存在着分化趋势,但分化并不严重。随后利用FST和hapFLK等方法,对肥尾绵羊和瘦尾绵羊两类具有极端表型的类群进行选择信号分析,这两类方法共筛选到了6个重叠的区域和43个重叠的基因,选择这两种方法筛选出来的重叠基因作为候选基因。并对重叠的6个区域进行成对FST方法验证,成对FST的结构表明,在重叠区域,肥尾与瘦尾巴之间的选择信号出现了峰值,而肥尾与肥尾之间以及瘦尾和瘦尾之间没有峰值。结果表明这6个重叠区域和有可能与绵羊的尾部脂肪的形成有关,这六个重叠区域筛选出来的重叠基因如:BMP2,PPP1CC,PROKR1,ETAA1,HOXA11,PDGFD等可能参与了绵羊尾部脂肪的沉积或绵羊的尾形的形成;随后我们对PDGFD进行western blot验证,结果表明PDGFD蛋白的表达量在3月龄胎龄和刚出生绵羊的尾部脂肪中没有明显的差别,但是在3月龄胎龄皮下脂肪和刚出生绵羊的肝脏中表达量有明显的差别;虽然这一结果不能支持PDGFD对绵羊尾型的形成有重要影响,但并不能否认其可能影响绵羊尾部脂肪测沉积。
其他文献
蜂王是蜂群中唯一具有繁殖能力的雌性个体,其品质的优劣与整个蜂群的群势及产量等息息相关。本试验利用不同直径王台(9.4mm、9.6mm、9.8mm与10.0mm)培育西方蜜蜂蜂王,检测王
七年了,经常会想起一个叫小八的小患者.记忆那么清晰,恍如昨日……rn毕业那年,我入职省儿童医院并分配到了重症监护室.这是一个可敬可畏的科室.收治着全省最病危的孩子,也有
期刊
我的眼神必须是坚定的rn“我的眼神必须要发自内心的坚定,这样才会给予患者更多的信心和力量.”1月31日,宣武医院驰援武汉医疗队分批次全部进入了隔离病房,开展救治工作.
期刊
本论文是以玉米秸秆、苜蓿、玉米黄贮为研究对象;通过体外消化和动物消化试验,在营养水平相同、精粗比不同的前提下,来研究肉牛日粮中玉米秸秆、苜蓿、玉米黄贮及精料补充料的组
本文利用遥感资料,解译水系图,并在GIS支持下,计算区域应力场的主应力方向,所得结果与用常规地应力测量和震源机制解译的应力场主应力方向相一致。 In this paper, we use t
蜜蜂囊状幼虫病是由囊状幼虫病病毒(Sacbrood virus,SBV)引起的一类蜜蜂传染病,而感染中华蜜蜂的囊状幼虫病病毒则被称为中华蜜蜂囊状幼虫病病毒,简称中囊病病毒(Chinese Sac
为跟踪近年来资源枯竭型地区经济转型发展的变化、取得的成绩和存在的问题,致公党中央调研组分别赴湖北潜江、安徽淮北、江苏徐州、黑龙江大兴安岭地区开展“资源枯竭型地区
覃塘区位于广西贵港市西北部,距离市区10公里,现辖7镇2乡1街道,总人口60.99万,其中壮族人口占60%以上.覃塘区物产丰富,是桂东南地区重要的商品集散、糖业生产基地,享有“甘蔗
期刊
试验分析研究冷应激环境下和维生素C(VC)的添加量对12~17周龄笼养金定育成蛋鸭生长发育及血液生化指标产生的影响。试验选用12周龄的健康金定蛋鸭(雌)216只,采用两因素的重复试验
此刻我们想说rn李少云:医务人不容易,病人更不容易.相互理解配合,必然迎来胜利.rn李 蕊:武汉飘雪冻彻大地,众人拾柴定会春暖花开!爱!不就是万众一心!爱!不就是泪眼相握!爱!就
期刊