在台湾的预算体制中，除了每年编列之总预算外，尚有一种为因应紧急重大情事而提出之特别预算，但台湾执政当局每每以特别法排除公共债务法第四条规定举债额度不得逾越岁出总额15％之规定来编列特别预算，使得公共债务年年高涨，预估至2007年止，累积未偿债务达4兆6467亿元。 本研究采用规范研究法及案例分析法针对台湾政府特别预算制度之相关法令及针对严重急性呼吸道症候群(简稱SARS)防治及纾困特别预算进行研究及分析，并比较世界各主要国家相关典章制度后，提出具体之策略及建议。 研究发现，目前台湾特别预算制度之运用已沦为行政恣意，立法怠惰之局面，朝野双方均置财政恶化于不顾。 本研究建议删除或修正预算法第八十三条特别预算之相关规定，回归预算单一原则，并落实财政健全为最佳方案，并再次声请大法官解释特别预算编列要件，来限制行政部门滥用特别预算，并应要求行政部门确实遵守财政纪律，立法部门及审计机关严予考核，才可使目前财政困窘之状态得以缓和。