物种形成是进化生物学和生物多样性研究的重要议题。长期以来我国西部山地的生物多样性产生机制一直备受关注。本研究通过对我国特有植物类群双盾木属(Dipelta)自然分布区内的种群进行大范围的群体采样,采用3个cpDNA片段和5个核基因片段的群体遗传学数据,结合物种的生态位模拟对双盾木属内物种间系统关系以及双盾木(Dipelta floribunda)和云南双盾木(D.yunnanensis)的物种形成过程进行探讨。基于3个联合的cpDNA片段的序列数据,从双盾木和云南双盾木56个居群的547个个体中识别了30种单倍型,有两种单倍型为种间共享;优美双盾木(D.elegans)的1个居群只存在1种单倍型。基于BEAST构建的系统进化树,明确了双盾木属下的三个类群,即:双盾木,云南双盾木以及优美双盾木。此外,单倍型系统发育分析显示,云南双盾木和双盾木是一对姊妹类群,优美双盾木为该属的基部类群。对核基因的分析结果显示,绝大部分的核基因单倍型为双盾木或云南双盾木独有,这个结果与两个种间显著的群体遗传结构和高水平的遗传分化是一致的。基于近似贝叶斯计算(ABC)模拟的最适分化模型显示,双盾木与云南双盾木在中更新世时期分化,这个时间与青藏高原的最大冰期时间一致。并且检测到了种间基因流的存在。研究结果表明,双盾木和云南双盾木的物种分化与第四纪的气候动荡有关,并在物种形成过程中经历了较长时间的基因流。另外,由于四川盆地的隔离作用使得这两个近缘物种存在对气候变化的不一致的种群动态响应。因此我们认为在理解第四纪冰期近缘物种分布模式及其对气候变化的响应过程中,复杂的地形结构应该作为一个考虑因素。总之,本文明确了双盾木属属下类群的分类地位,也对双盾木属物种的谱系分化关系进行了研究,为生物多样性保护工作提供了参考依据。另外,对双盾木与云南双盾木异域分布模式的研究,将为以后具有相同分布区或类似分布特征物种的研究提供参考范例。