SELDI技术联合MATLAB软件预测FOLFOX4方案治疗大肠癌敏感性的研究报告

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:jst1984
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目的:探索用SELDI技术联合MATLAB软件预测和判断FOLFOX4方案治疗大肠癌疗效的可行性。方法:留取FOLFOX4方案化疗前60名有可观察指标的大肠癌患者(男性38例、女性22例)血清,行SELDI-TOF-MS技术(surface-enhanced laser desorption / ionization time of flight mass spectrometry表面增强激光解析离子飞行时间质谱技术)检查,描绘其指纹图谱为分析用。第一阶段工作:12名大肠癌患者入组,FOLFOX4方案治疗后根据实体瘤疗效评价标准将这些患者分成:稳定组(SD)、无效组(PD),采用ProteinChip 3.2.0软件和Biomarker Wizard 3.1软件分析两组间的差异蛋白质指纹。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指纹的拟合曲线及曲线方程,修正界定指纹;第二阶段工作:48名准备接受FOLFOX4方案化疗的大肠癌患者入组,接受三个周期的FOLFOX4方案化疗后,将化疗前的指纹根据第一阶段预测疗效界定标准将患者分成符合指纹人群和不符合指纹人群,分析按实体瘤疗效评价标准分成的SD和PD组患者指纹中相同质/核比(M/Z)的蛋白质含量(丰度)与实际疗效的相关性,并界定能反映疗效的指纹丰度。结果:(1)有3个差异蛋白质峰(M/Z为2868、1204、4176)在稳定组和无效组中有统计学意义(p<0.05),基线漂移(drift)±50H+。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指纹的曲线且曲线方程均呈线性的函数关系。因此,M/Z: 2868±50H+丰度下调,M/Z:1204±50H+、4176±50H+丰度上调与疗效提高呈正相关,反之亦然。(2)以M/Z:2868±50H+丰度<10归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为66.7%,无效组中指纹符合率为71.4%;以M/Z:1204±50H+丰度>10归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为74.1%,无效组中指纹符合率为81%;以M/Z:4176±50H+丰度>40归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为70.4%,无效组中指纹符合率为81%。结论:借助于蛋白质指纹技术及MATLAB软件预测FOLFOX4方案治疗大肠癌的耐药是可行的。经SELDI检查,其指纹图谱M/Z:2868±50H+、1204±50H+、4176±50H+为预测FOLFOX4方案治疗大肠癌敏感性的指纹标识,其M/Z:2868±50H+丰度<10、1204±50H+丰度>10、4176±50H+丰度>40为预测FOLFOX4方案治疗大肠癌可获得稳定的标识指纹;其M/Z:2868±50H+丰度≥10、1204±50H+丰度≤10、4176±50H+丰度≤40为预测FOLFOX4方案治疗大肠癌无效的标识指纹。
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