生物信息学方法研究内源性RNAi及其介导的基因调控网络

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RNA干扰现象是近年新发现的一种自然存在的生物学现象,它是指由与靶mRNA序列相互补的双链RNA介导的使mRNA降解,并导致转录后基因沉默的一种机制,是生物界古老而且进化高度保守的现象之一,在基因功能研究和基因药物等方面具有广泛的应用前景,是近年来生物学研究的热点问题。目前,内源性RNA干扰的机制还不是非常明确。 本文根据RNA干扰的基本原理,运用生物信息学的原理和方法,通过计算机编程寻找和RNA干扰相关的反向互补序列,在各种模式生物基因组中找到大量发夹一靶点作用对,并统计了这些序列在各种模式生物基因组中的分布情况,推测存在一个由内源性RNA干扰参与的一个基因调控网络。在此基础上,重点研究了一类发夹在内含子中靶点在外显子中的情况,从理论上给出了可能存在的基因调控关系。另外,本文给出了一些生物信息学常用的计算方法并编写出一系列处理生物信息数据的通用程序。
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