自我国《企业破产法》引入破产重整制度以来,其逐渐成为我国破产法学者研究的“显学”。该制度一改过往在破产程序中过分着眼于公平清偿以实现债权人利益的不足,致力于实现债务人企业、债权人、出资人等各方的共赢和社会利益的保护,促进危机企业的复兴再生,得到了理论界对其价值的充分肯定。在司法实务中,法官等实务工作者也越来越重视重整制度的积极作用以及出资人这一特殊主体在其中的法律地位和合法权益。重整过程中出资人权益保护问题仍然是一个争议点和难点,笔者希望通过本文来讨论出资人权益保护的相关问题,完善不足,助力我国破产重整制度的发展。本文的第一部分是案例引入部分,通过对两个案例的介绍,简要说明在我国重整实践中对出资人权益保护的现状和争议点,引出本文所要讨论的相关问题,如重整中出资人权益是否需要保护?为什么需要保护出资人权益?对出资人权益进行保护是否要对出资人分类区别对待等问题,从而为之后的讨论分析打下基础并指明方向。第二部分论述了出资人权益保护的理论基础,首先梳理了理论界关于出资人权益保护的两种不同观点,之后阐述了出资人权益保护的必要性和基本原则。文章认为,保护出资人权益可激励各方积极参与重整,也体现了商法对商事自治的尊重,契合重整制度的社会本位宗旨。保护出资人权益需要遵循债权人优位原则、公平、公正原则以及私法自治原则。第三部分的主要着眼点是在重整企业绝大多数是净资产负值企业这一现实状况下,对出资人权益进行保护的困境与解决。由于理论上尚存争议,司法实践中对出资人权益的保护仍然不理想,当务之急是完善营运价值理论的论述,破除各方对账面净资产的误解,厘清出资人权益和账面净资产的关系,为出资人权益的保护提供充分的理论基础。第四部分讨论了与出资人权益保护相关的程序问题,重整中出资人权益的保护需要一个完善、系统的程序架构,但是目前立法过于原则,出资人的很多程序权利亟需完善。应当放宽出资人重整申请权的限制,赋予出资人重整计划制定中的参与权,完善出资人的相关表决权规则,以便出资人更好的参与到重整过程中。第五部分将研究视角拉近出资人内部,针对实务中对出资人权益进行区别对待的问题,本文主张商法应当充分尊重各方的意思自治,原则上不做干预,并贯彻对股东的平等保护原则。对有过错的大股东,区别经营责任和法律责任,进行适当的处罚,而非没有依据的区别对待。