[背景] 卫生研究对于人群健康的作用越来越重要，国际社会越来越重视卫生研究系统能力建设。当前的卫生研究与解决主要的卫生问题还有很大差距，资源不足与浪费并存。上海市卫生研究成果显著，但卫生研究系统的运行状况不甚明了，当前国内关于卫生研究系统的研究几乎没有。因此对上海市卫生研究系统的功能进行分析，可以发现其内在的潜力和不足，为加强上海市卫生研究能力建设，促进人群健康公平性提供参考。 [研究目的] 本研究从管理、人力、筹资、成果转化四个方面对上海市卫生研究系统进行功能分析和评价，探索上海市卫生研究系统存在的优势和劣势，并提出强化上海市卫生研究能力、促进卫生研究发展的政策建议。 [资料来源和方法] 1、文献评阅查阅了2000年和2001年《高等学校R&D资源调查暨科技统计(理、工、农、医类)工作文件》，WHO相关工作文件，查询上海市卫生局、上海科委、中国卫生部、WHO卫生研发委员会以及WHO卫生研究全球论坛网站等，收集有关上海市各部委在卫生研究方面的政策、法规、卫生研究计划与重点等。 2、关键知情人访谈关键知情人包括上海卫生局、科委、教委、计生委、重点医学院校的科研处处长，共8人。通过面对面深入访谈的方法了解上海市卫生研究系统基本管理构架、卫生研发成果及经费流动现状等。 3、科技统计报表收集查阅1999年到2003年的上海市高等医学院校，县级以上独立研究和开发机构的科技统计资料汇编。对获得的数据进行整理、汇总与审核，采用Excel2003软件进行统计分析。主要使用时间序列分析法对1999年-2003年的数据进行分析，并对不同类型科研机构进行比较研究。 4、现场调查 2006年12月对上海市研究所、医学院校、三级甲等医院和卫生研究管理部门进行现场调查，根据卫生局提供的单位信息，典型选择了60家机构，填写问卷者为科研处(科)或者分管科研的行政管理人员。回收了55家，问卷回收率为91.7％。回收问卷的单位包括11所医学院校(包括二级学院)，15所研究所，25所三甲医院，4家政府机构(包括上海市卫生局、上海市计划生育委员会、上海市科委和上海市教委)。 数据使用Epidata3.02软件建库录入，SPSS11.0软件、Excel2003软件进行分析。 [研究结果] 1、上海市卫生研究优先领域虽然明确，但是没有系统的设置方式，没有严格的评审和监督程序，优先领域的实施尚不到位。重临床和基础研究，轻预防和社会医学研究。多头管理带来分工不明，资源浪费，重复建设。科研系统的伦理委员会建设不成熟。 2、资金投入不足，1999-2003年五年之中一直呈上升趋势，其中科研人员支出占主要部分。研究与发展(R&D)费用五年中也随着投入的增加而上升。高校及附院的R&D的经费投入比县级以上独立研发机构的R&D投入高。资金投入以公共部门为主，主要涉及临床和基础医学方向，关系到人群健康的传染病预防与控制、慢性病计划防治、社区卫生服务建设等方面的科研经费较少。影响筹资的因素包括经费缺乏、卫生研究网络建设不足、卫生研究缺乏与卫生问题的相关性、研究者、机构和政府部门的合作不足等，经费不足与浪费并存。 3、卫生研究系统人力资源总数近年有下降趋势，存在一定的流失问题。上海市的科研人员总体上以中青年为主，年轻人数量较少，后备显得不足。研究人员的科研能力有待提高，研究环境有待改善。 4、独立研究机构论文发表数量五年来没有明显变化，高校及附院的发表论文数逐年增长，独立研究机构的论文发表数比高校及附院的论文发表数少，且增长速度较慢。各研究产出机构研究结果利用与转化不足，影响结果利用的因素主要有研究质量差、研究的适时性、使用证据的能力有限、实施资源有限、缺乏研究者与使用者之间的交流和沟通。信息收集、统计和发布系统不健全。 [建议] 1、建立资助者、研究者与使用者的沟通平台，对卫生研究系统进行整体规划，设置科学的优先研究领域；建立健全的卫生研究评审程序和伦理监督制度。 2、建立卫生研究经费统一管理体制，提高配置效率，发展卫生研究多元化筹资体制，增加政府对公共卫生领域的经费投入，提高健康的公平性，建立完备的经费流向监测部门。 3、加强人力资源能力建设，形成良好的人才梯队，吸引研究型人才，培养各学科研究人员的科研能力，全面改善研究环境。 4、加大激励研究成果转化的力度，提高科研人员转化成果的积极性，引入市场机制，建立完善的卫生研究信息系统，加强卫生政策和卫生研究的联系，促进卫生政策的科学制定。