随着我国城镇化进程的不断加快,房地产行业迅速发展,土地增值税日益成为新的税收增长点。在当前新一轮税制改革的大趋势下,全面提升土地增值税征管水平,一方面可以更有效地抑制房地产行业过分投机和炒作,另一方面又能更大程度地避免地方政府过度依赖土地财政而造成土地资源的严重浪费。因此,为了充分发挥土地增值税规范土地和房地产市场交易秩序、合理调节土地增值收益的作用,无论是房地产企业还是税务机关都应该重视土地增值税的征管工作。目前,土地增值税清算是房地产企业开发过程中十分重要的环节,而土地增值税清算的审核更是地方税务机关的必要工作,那么,同时研究税务机关和房地产开发企业的土地增值税清算过程,对于规范税企双方清算工作都是十分有意义的。在这一背景下,本文采用案例分析的方法,选取A房地产企业B开发项目的土地增值税清算为研究案例,通过分析A企业和其主管税务机关在土地增值税清算过程中的差异,得出结论:税务机关和房地产开发企业在土地增值税清算的各个环节上均存在不同程度的差异,这些差异不仅会导致税企双方出现不同的清算结果,还会影响整个清算工作的进行甚至阻碍税企之间的业务交流与合作。本文研究表明,B房地产开发项目土地增值税清算出现税企之间差异的原因来自税企双方,所以税务机关和房地产企业需要同等重视土地增值税清算工作:企业在项目清算中应该综合考虑自身实际情况、所处的税法环境及与外部的沟通协作等情况以提升自身土地增值税清算能力,税务机关则应该针对A企业的实际情况积极主动帮助和配合企业完成土地增值税的清算工作。总之,税企土地增值税清算出现差异是客观存在的,土地增值税清算复杂难懂,加上土地增值税政策又在不断更新变化,实时把握好土地增值税清算的正确方向对税企双方来说都是不易的。因此,税企双方要想顺利的完成土地增值税清算工作,克服清算差异带来的不良影响,达成互利互惠的双赢合作,就必须共同发力,缺一不可。