当前，国际金融危机对全球经济发展的影响远未消除，经济复苏动力仍显不足。在这种大背景下，创新已成为经济社会发展的主要驱动力，各国为掌握国际竞争主动，纷纷把深度开发人力资源、实现创新驱动发展作为战略选择。一个行业或者企业要在这恶劣的环境中生存并发展，就必须依靠创新。影响技术创新的因素很多，其中学者们研究最多的一个因素就是市场结构，关于技术创新与市场结构关系的研究也一直是产业组织学家们最关注的热点问题，但是关于两者的关系始终没有统一的论断，已有的大量文献大部分假设市场结构和技术创新外生，而且大部分主要研究了市场结构对技术创新的单向影响，忽略了技术创新对市场结构的反向影响，而在现实中，两者往往是双向互动、相互影响的。　　 本文首先对技术创新与市场结构的相互影响机理进行了理论分析，从技术创新对市场结构的影响和市场结构对技术创新的影响两个方面进行，在研究技术创新对市场结构的影响时，从成本降低、产品创新和研发专用性三个方面进行分析。在研究市场结构对技术创新的影响时，从市场结构的基本因素和基本形态两个层面进行分析，得出适度垄断最有利于创新。接着，在理论分析的基础上，本文以技术创新和市场结构存在内生性、相互影响关系为假设前提，在已有研究的基础上建立技术创新和市场结构方程组成的联立方程计量模型，对2002-2010年我国13个资源型产业的大中型企业进行了实证分析，模型检验的结论为:技术创新与市场结构两者确实存在着双向互动关系，而且两者互为负相关关系，又通过统计分析验证了计量检验结论的正确性。本着理论联系实际的原则，在理论和实证分析的基础上，对优化我国资源型产业市场结构，提升创新能力方面提出了相应的对策建议。