蔷薇科和葫芦科植物中NBS基因的进化分析与比较

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NBS-LRR(核苷酸结合位点-富亮氨酸重复)蛋白是植物中最大的一类抗病蛋白。很多植物基因组中的NBS基因家族已经被鉴定和深入研究。但是,在蔷薇科和葫芦科植物中,NBS基因家族还没有进行全面、深入的比较和分析。本研究选取了五个全基因组测序的蔷薇科植物,苹果、梨、桃、梅和草莓,分析和比较了他们基因组中NBS类抗病基因的进化模式,同时与三个葫芦科植物,黄瓜、甜瓜、西瓜的NBS基因进行了比较。研究发现,蔷薇科植物和葫芦科植物NBS基因的数目存在很大差异。在蔷薇科物种中,NBS基因的数量很多,他们在整个基因组中所占的比例也很高,分别为:桃(437,1.52%),梅(475,1.51%),草莓(346,1.05%)和梨(617,.1.44%),而苹果包含了 1303个NBS基因,占总基因组的2.05%,是所有已报道的双子叶植物中抗病基因数目最多的物种。然而,葫芦科物种中只检测到不足100的NBS基因。此外,在蔷薇科植物中,尤其是苹果中,发现了很多受到正选择作用的物种特异性家族。我们的研究表明在蔷薇科植物中,尤其是在苹果中,NBS基因经历了急速的扩张和快速的适应性进化。这为进一步研究蔷薇科植物抗病基因的进化模型提供了有用的信息。
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