在计划经济向市场经济转型的过程中，科研院所的有效运作和科学管理将面临巨大挑战。本文探讨了科研院所在管理方面特别是人员激励、考核方面存在的问题，并提出了相应的解决办法。目前，我国科研院所普遍推行项目管理模式，但在人员激励、考核方面却无法真正适应这种制度，设计单位在人员培训方面做的也还不够完善，这对于人员激励和提高科研院所的总体水平是不利的。再者，如何兼顾短期激励与长期激励，这是值得深入考虑的。一般认为股权激励是一种有效、长期激励方式。本文在对员工激励理论、知识型员工激励因素作了深入论述、分析的基础上，通过分析我国设计单位人力资源激励制度的现状，对我国科研院所员工激励制度目前存在的问题、对策和未来发展作了一个深入而全面的阐述，为我国设计企业人力资源管理理论的发展与实践提供了借鉴。只要我们放开眼界，虚心学习，勇于实践，中国设计企业的管理腾飞指日可待!