四倍体马铃薯高密度分子遗传连锁图谱构建及淀粉含量等重要性状的QTL定位

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:dbfan
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马铃薯是重要粮食作物之一。随着国家马铃薯主粮化战略的实施,市场对淀粉、全粉、薯片、薯条加工专用型马铃薯品种的需求量不断增加。为了培育高淀粉、高干物质加工型马铃薯新品种,构建马铃薯高密度分子遗传连锁图谱以及定位重要品质和产量性状的QTL,本试验以四倍体马铃薯“YSP-4”和“MIN-021”为亲本进行杂交,获得了马铃薯杂种F1代182个分离单株,并提取其基因组DNA。采用SRAP和SNP两种分子标记,构建其双亲的高密度遗传连锁图谱,并测定两年两点4个不同环境条件下的杂种F1代分离群体的块茎淀粉含量、干物质含量、单株产量和商品薯率4个重要性状,以定位其相应性状的稳定主效QTL。该研究可为深入开展马铃薯品质及产量等重要性状QTL精细定位,相关基因图位克隆、功能分析及分子标记辅助育种等研究奠定基础。主要研究结果如下:1.试验筛选出适宜SRAP引物组合36对,对马铃薯杂种F1代182个分离单株及其亲本的基因组DNA进行扩增,得到742个SRAP条带位点,其中多态性位点598个,多态性比率为80.59%。2.利用SLAF-seq高通量基因组测序技术,检测得到稳定的用于遗传作图的SNP标记3,001个。3.标记偏分离分析显示,母本图谱中共有1,995个分子标记,其中偏分离标记157个,偏分离比率仅为7.87%;父本图谱中共有1,776个分子标记,含97个偏分离标记,偏分离比率仅为5.46%。这符合植物遗传作图偏分离标记小于30%的要求。4.采用“双假测交”策略,构建了两张各含12个连锁群的双亲高密度遗传图谱。其中母本图谱覆盖基因组长度1,829.19 cM,含1,995个标记,标记间平均图距0.92 cM;父本图谱覆盖基因组长度1,810.44 cM,含1,776个标记,平均图距1.02 cM。5.四倍体马铃薯F,分离群体的淀粉含量、干物质含量、单株产量及商品薯率4个表型性状间均呈正态分布且存在一定程度的相关性和差异显著性。6.在已构建的高密度遗传图谱上对块茎淀粉含量、干物质含量、单株产量及商品薯率4个重要性状进行QTLs定位,共检测到稳定QTLs 23个。其中父本图谱中检测到11个稳定QTLs,分别是5个淀粉含量QTLs、3个干物质含量QTLs、2个单株产量QTLs和1个商品薯率QTLs,其遗传贡献率变幅为10.6%~41.7%;母本图谱定位到12个稳定QTLs,包含1个淀粉含量QTLs、6个干物质含量QTLs、3个单株产量QTLs和2个商品薯率QTLs,其遗传贡献率变幅为10.7%~44.8%。7.在检测到的23个稳定QTLs中,含7个主效QTLs。父本图谱中检测到3个主效QTLs,其中控制淀粉含量2个(qLM7SC45和qLM7SC46),单株产量1个(qLM4TY22),遗传贡献率变幅为20.7%~41.7%;母本图谱中检测到4个主效QTLs,其中控制淀粉含量1个(qLF5SC16),干物质含量3个(qLF4DM11、qLF1DM23和qLF5DM65),遗传贡献率变幅为26.0%~44.8%。
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