通用stem-loop引物方法筛查和定量检测免疫抑制患者的microRNA

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Moke_jlsf
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目的:  RT-qPCR技术广泛应用于microRNA(miRNA)表达定量,其中stem-loop RT-PCR技术使用最为频繁,但是该方法耗时耗试剂,并且不利于快速筛选miRNA。因此我们欲建立一种能快速筛选和定量miRNA的新方法。  方法:  1、本论文建立了一种新的称为“通用stem-loop引物”(USLP)方法,该方法将传统stem-loop(TSLP)的3端的特异性片段替换成8个随机碱基,使其能快速筛选和定量miRNA。  2、设计了三个实验测试USLP方法的敏感性、特异性和重复性;  1)将合成的miR-155标准品十倍梯度稀释7个数量级(109-103拷贝/μL),并将稀释后的不同浓度的miR-155作为模板进行qRT-PCR以观测方法的敏感性;  2)将PCR产物通过3%琼脂糖凝胶电泳、溶解曲线和测序三种方法共同验证USLP方法的特异性;  3)选取3个浓度梯度的合成miR-155标准品(108-106拷贝/μL)进行qRT-PCR重复实验二十次,用以验证新方法的重复性;  3、将29例健康体检和58例服用FK506(免疫抑制剂)的肾移植患者的T淋巴细胞激活培养,通过比较USLP和TSLP两方法在T淋巴细胞激活的不同时间段(0h、24h、48h和72h)的miRNA表达变化,来判断新方法的实际应用情况。  结果:  1、通过使用Primer5软件成功设计用于RT的通用stem-loop引物、以及相应的qPCR引物,包括特异性的正向引物和通用反向引物。  2、USLP方法的敏感性、特异性和重复性结果:  1)敏感性:最低可以检测到103拷贝/μL的模板RNA。  2)特异性:通过分析溶解曲线、琼脂糖凝胶电泳和测序结果,可以得出USLP和TSLP方法的PCR后产物单一且为目的产物。  3)重复性:CV值<2.5%,说明USLP方法的高重复性。  3、健康体检和服用FK506的肾移植患者外周血的T淋巴细胞刺激培养不同阶段的miRNA表达变化:  1)使用USLP方法发现,miR-150-5p(miR-150)和miR-155-5p(miR-155)随着T淋巴细胞刺激培养时间延长出现表达变化:miR-150在72h时表达降到最低,降低了约10倍;miR-155在72h时表达升高到最高,升高近7倍。  2) USLP检测在T细胞激活过程中miR-150与miR-155表达变化趋势与TSLP方法一致。  3)健康体检人员和免疫抑制肾移植病人的T细胞经PHA刺激培养48h后,免疫抑制病人的miR-150和miR-155变化的幅度小于健康体检人员。  结论:  1、USLP方法是一种简单、快速、价廉,并能筛选和定量miRNA的新方法。  2、随着T细胞激活,免疫抑制患者和健康体检人员的miR-150与miR-155表达变化幅度不同,暗示检测miR-150与miR-155对判断个体免疫系统的状态有意义。
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