环保产业是生态文明建设和污染防治攻坚战的中坚力量。我国正处在绿色发展转型阶段,在环境保护政策的带动下环保产业有快速发展态势。环保属于技术密集型领域,产业的发展需要持续的技术创新作为支撑,技术创新是提高核心竞争力和促进经济增长的源泉,研发投入是创新能力的前提条件,有效的研发投入能促进企业绩效的提升。本文选取2016～2019年179家新三板挂牌环保公司作为研究对象,研究数据来源为WIND数据库和经审计后的公司年度报告,采用EXCEL2016、SPSS26.0软件和SPSSAU软件对研究数据进行了描述性统计分析、相关性分析、回归分析。构建的固定效应模型中解释变量为研发费用投入强度,被解释变量为企业绩效,企业绩效由主成分分析法计算而得的综合指标和企业盈利能力两个维度衡量,引入企业规模、股权集中度、现金实力作为控制变量,实证研究了研发投入对企业绩效的影响以及滞后效应。研究结论为:其一,在2016～2019年期间,环保公司企业规模较为接近;股权集中度较高;盈利能力、发展能力、偿债能力和营运能力差异化明显;平均研发费用投入强度为7.74%,研发费用投入强度较高;企业综合绩效具有差异性。其二,研发投入与当期企业综合绩效显著负相关;研发投入与当期企业盈利能力显著负相关;研发投入与滞后二期企业综合绩效显著负相关;研发投入与滞后一期、二期、三期企业盈利能力均显著负相关。其三,研发投入对当期企业综合绩效和企业盈利能力均具有显著负向影响;研发投入对滞后二期企业综合绩效无影响;研发投入对滞后一期、滞后二期、滞后三期企业盈利能力均无影响;未发现研发投入对企业绩效影响具有滞后效应。研究发现环保公司面临研发投入有效性欠缺、研发周期长、研发效率低、研发管理水平较低、研发信息公开披露制度不完善等问题。为促进新三板挂牌环保公司研发活动可持续发展,政府需完善研发信息披露制度和加强研发活动的支持力度,环保公司需完善研发信息公开披露制度,缩短研发周期,提高研发效率,提高研发管理水平,维持长期且有效的研发投入。研究对环保公司的研发管理具有借鉴意义,为环保公司提升企业绩效提供参考依据。