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甜瓜是世界十大水果之一。甜瓜具有丰富的表型变异和遗传变异基础,特别是果实性状,如果实形状,果实皮色,果面沟、网纹、皱纹、裂纹,果肉厚度、颜色及糖酸含量等,而这些性状大多为重要的农艺性状,因此,果实性状的遗传改良一直是育种专家们共同关注的目标。种子形态特征也是甜瓜中一类重要的性状,不同材料种子大小、形状、颜色差异较大,饱满健康的种子是甜瓜苗期健壮发育以及后期产量和品质的基本保障。采用群体遗传学的方法,并结合现代基因分型技术,检测甜瓜染色体上调控这些重要性状的位点,进而鉴定出候选基因,不仅可以挖掘到调控目标性状的功能基因,还有利于解析性状的遗传基础,为将来的分子育种打下坚实基础。本试验以小型圆果甜瓜ZTG00581为母本、蛇形长果甜瓜ZTG00906为父本,构建F2及F2:3群体为试验材料,并分析果实和种子性状的变异特征。通过对亲本重测序以及140个F2单株简化基因组测序,构建高密度连锁遗传图谱,并结合果实和种子性状的表型,对甜瓜果实和种子性状进行遗传定位,与前人研究结果进行一致性分析。具体结果如下:(1)表型性状的变异分析3种环境下对9个数量性状(果实重量、果实长度、果实宽度、果形指数、果肉厚度、种子千粒重、种子长度、种子宽度、种形指数)进行统计分析,除种形指数外,其他性状在亲本间均存在显著性或极显著性差异。数量性状在F2中的频数分布表明,这些性状均趋向正态分布。Pearson相关系数分析表明,果重、果长、果形指数在3个环境(F2、两季F2:3群体)下相关程度较高(r>0.6),种子长、种宽、种形指数呈中等相关(0.39、PVE>21%)位于LG8,物理区段为194.16Kb。检测到7个果实长度QTL,其中 qF12.1(LOD>13、PVE>27%)和 qF18.1(LOD>7、PVE＞13%)在多环境下均检测到,分别位于LG2和LG8上,物理区段分别为630.95Kb和85.37Kb。检测到6个果实宽度QTL,但仅在一个环境下出现,其主效QTL位点qFd2.1(LOD=7.13、PVE=17.54%)位于LG2,物理区段为68.75Kb。检测7个到果形指数QTL,其中qFsi2.1(LOD>14、PVE>30%)和qFsi8.1(LOD>4、PVE>8%)在多环境下均检测到,分别位于LG2和LG8上,物理区段分别为630.95Kb和85.37Kb。果肉厚度有2个QTL位点,qPth2.1、qPth11.1位于LG2和LG11(LOD>3、PVE>9%)。检测到 4 个网纹性状 QTL,其中主效 QTL qNw2.1(LOD=26.47、PVE=54.92%)位于 LG2,物理区段为 351.32Kb。(4)种子性状QTL定位共检测到31个种子相关QTL位点。种子千粒重有4个QTL,未检测到重复性的位点,其主效 QTL 位点 qSw3.1(LOD=4.19、PVE=10.95%)位于 LG3,物理区段为 3981.95bp。种子长度 QTL14 个,其主效 QTL 位点 qS13.2(LOD=15.09、PVE=18.74%)位于 LG3,物理区段为184.42Kb。检测到3个果实宽度QTL,qSd4.1(LOD>3、PVE>8%)在两个环境下均有出现,物理区段分别为317.08Kb,另外1个QTL位点qSd11.1(LOD=3.82、PVE=7.96%),物理区段分别为2785.65Kb。种形指数共有10个QTL位点,仅有qSsi6.1(LOD>3、PVE>9%)在多次环境下均有检测到,物理区段为231.57Kb。(5)质量性状的定位将黄果皮基因初步定位在4号染色体前端,物理位置为1-3,279,342bp,前人已报道该区段中MELO3C003375基因是控制果皮黄/绿的候选基因;将白色种皮颜色基因定位在5号染色体的3,863,931-4,235,229bp位置上,与已报道的白色种皮初定位置一致。