线粒体是存在于真核细胞细胞质中的一种细胞器,它有一套类似于细胞核DNA的遗传物质,即线粒体DNA(mt DNA),可独立进行复制、转录以及翻译过程。mt DNA具有突变率高、非重组、母系遗传等特点,是评估家畜母系起源、遗传多样性、系统发育和种群结构的关键工具。云岭牛是我国第一个采用三元杂交方式培育成的肉用牛品种,综合了1/2的婆罗门牛(Brahman)血统、1/4的莫累灰牛(Murray Grey)血统以及1/4的云南地方黄牛血统。云岭牛具有较强的环境适应性,耐粗饲能力强,对体内外寄生虫等有较强的抵抗力,具有生产雪花牛肉的潜力。评估云岭牛的遗传特性以及母系起源对于合理制定云岭牛育种策略和云南地方牛保护计划尤为重要。本研究采集了129头云岭牛和31头婆罗门牛(对照)耳组织样本,利用二代测序技术对线粒体DNA基因组进行测序,并对云岭牛的遗传多样性以及母系起源进行探讨。主要研究结果如下:1、基于线粒体DNA全基因组分析,在129头云岭牛中共发现47种不同的单倍型,其单倍型多样度为0.964±0.007,核苷酸多样度为0.00784±0.00013,说明云岭牛具有丰富的遗传多样性。2、系统发育分析结果表明,云岭牛有普通牛和瘤牛2个母系起源。聚类显示云岭牛线粒体DNA基因组包括普通牛T1、T2、T3、T4、T6和瘤牛I1、I2共7个单倍型组,其中瘤牛I1单倍型组占比最大(41.86%),其次是普通牛T3单倍型组(28.68%)。3、在云岭牛中发现了一个新单倍型组T6,推测可能与云南地方黄牛复杂的起源有关。本研究通过系统分析云岭牛线粒体DNA基因组的遗传多样性和系统发育情况,有助于全面了解云岭牛的群体结构和母系起源,为云岭牛的评价和有效管理提供理论依据,同时对云南地方黄牛的遗传资源保护与利用也提供一定的科学依据。