本文以金财工程、政府采购、国库集中支付制度建设为背景，以全流程管理为理念，提出在政府采购中运用这一理念，研究管理信息系统的构建。笔者以N市政府采购管理信息系统的建设为研究对象，全面介绍了系统建设开发的两个阶段，软件构架，硬件及网络构架，以及系统的功能及流程。之后，基于政府采购全流程管理，提出整合信息管理系统的需要，并介绍了整合运行情况。结合系统运行的现状，分析了当前面临的阶段性的问题，对已运行的系统与国库集中支付系统的整合过程；通过对整合后运行的系统进行了深入的研究，从政府采购预算编制、资金支付以及资产管理等三个方面，阐述了存在的不足和缺陷，包括主要是信息系统互相关联度不够的现象，进行了分析。最后，提出全面解决方案：一是进一步完善政府采购预算编制与执行；二是加强以国库集中支付制度为主体的政府采购资金支付的管理；三是以资产管理为切入点，建立动态的国有资产管理系统，进一步推进政府采购的全流程管理；四是完善系统建设，加强系统整合力度；五是加强政府采购监督机制，提高采购资金的使用效率；六是完善系统建设的同时还应加强系统维护和改进。