随着广西农业和农村经济的发展，特别是农业科技体制改革的不断深化，在社会主义市场经济体制日益完善的今天，农业和农村经济发展的外部环境发生了历史性转变，由此而对市级(地级市)农科所的结构和功能提出新的要求。在新形势下，广西市(地级市)级农科所应如何清楚地认识到自身改革与发展中存在的问题，寻求发展的对策，已经成为当前亟待解决的问题。 在研究过程中，笔者结合业务工作的开展，选择广西高、中、低三个发展水平的市级(地级市)农科所进行了农业科技成果与服务能力、人员的年龄结构等方面的调查，采取定性研究与定理研究相结合、现状研究与预测研究相结合的方法，从全国市(地级市)级农科所的改革情况入手，在认真分析广西市级(地级市)农科所改革与发展的现状、做法和经验的基础上，对市级(地级市)农科所目前面临的一系列问题进行了较为深入的研究，包括科研方向不明确、科研经费严重不足、科研人才后继无人、科研手段落后等，其实质性的问题是现有的农科所管理体制已经越来越同社会主义市场经济的发展不相适应了。笔者认为，广西市级(地级市)农科所要在新形势下创造良好的发展机会，必须在不断深化农业科技体制改革的前提下，积极探索一种符合农业科技自身发展规律和市场经济运行规律、有利于农业科技持续创新进步、促进农业科技与经济有机结合的新机制。 根据13个市级农科所运行的现状以及未来改革和发展的方向，本研究提出了五类可选择性的改革对策，使其从目前仍然以计划经济体制为主导的运行方式，逐步顺利地过渡到符合市场经济原则的以市场和当地农业、农村和农民发展需求为导向的运行机制。为此，在对其进行进一步的改革过程中，需要强调结合自身特点，扬长避短，明确发展方向；建立新型的农业科技管理体制，使管理模式更加适应现代农业发展的要求；进一步优化人才资源素质与结构，提高科技水平；树立市场与效益观念，强化科研开发工作的市场导向；加快科技成果转化，争取多元化的农业科技投入；发挥种质资源优势，推进种子产业化经营。