在中共十九大明确“第二轮土地承包到期后再延长三十年”的背景下,必将会有更多的土地流转到新型经营主体。农民合作社作为新型经营主体的重要形式,深入研究其治理结构,对于保护合作社社员利益、规范和促进合作社发展、推动农业产业发展和乡村振兴有着重要的理论意义和现实意义。本文依据当前存在少数社员控制农民合作社的现实背景和少有学者对少数社员控制农民合作社进行正面研究的理论背景,提出了本文要研究的问题——少数社员控制农民合作社的重要影响因素。在提出要研究的问题后,依托交易成本理论、委托代理理论、利益相关者理论和国内外专家学者在合作社控制相关方面的研究归纳出了资金资源、社会人力资本、社员的认知能力、社员代表大会的作用、利润的分配制度、设立个人账户情况、牵头人的服务意识、退社时是否自由、合作社外部监管情况、合作社内部监管情况和合作社类型是少数社员控制农民合作社的重要影响因素。并据此提出了“理事会及监事会成员投资占合作社总投资的比例高对合作社被少数社员控制呈正向影响”、“农民合作社牵头人的主要社会关系对于合作社被少数社员控制具有正向影响。”、“普通社员对合作社的认知能力差对于合作社被少数社员控制具有正向影响。”、“合作社不按照合作社章程规定返还盈余和股金分红对合作社被少数社员控制具有正向影响。”、“不设立成员账户对合作社被少数社员控制具有正向影响。”、“合作社理事长的服务意识弱对合作社被少数社员控制具有正向影响。”、“社员退出农民合作社的能力差对合作社被少数社员控制具有正向影响。”、“外部监管频率低对合作社被少数社员控制呈正向影响。”、“内部监管频率低对合作社被少数社员控制呈正向影响。”和“非生产类合作社比生产类合作社被少数社员控制呈正向影响。”11个理论假说。而后对测量指标进行了选取并对自变量和解释变量进行了说明和取值。在实证分析阶段,首先阐述了从某市区进行获取数据的情况并对数据进行了描述性统计,而后采用Cronbach’s a值和巴特利特球度检验及KMO检验对问卷进行了信度检验和效度检验,检验结果显示,Cronbach’s a值为0.704,巴特利特球度检验的Sig值为0.00,KMO值为0.784。最后将通过信度检验和效度检验的数据带入到二元Logistic模型中进行回归分析。回归分析结果显示,“理事会及监事会成员投资占合作社总投资的比例”、“合作社牵头人的主要社会关系”、“普通社员对合作社盈余分配和民主管理制度的了解程度”、“合作社是否按照合作社章程规定返还盈余和股金分红”、“合作社是否设立个人账户”、“社员退社时是否退还社员出资额、公共积累和未分配财产”、“合作社外部监管频率”、“合作社内部监管频率”八个变量Sig值均小于0.05,即这八个影响因素均是影响少数社员控制合作社的显著因素。而“合作社理事长的服务意识”、“社员代表大会召开的频率”和“合作社类别”这三个因素Sig值分别为0.133、0.633和0.125,均大于0.05,即这三个因素不是影响少数社员控制合作社的显著因素。文章的最后依据研究结论在完善合作社表决机制、改善利益分配制度和健全监督体系方面提出了一些建议。