2006年为贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006—2020年）》，中央财政特设立“中央级科学事业单位修缮购置专项资金”（以下简称修购专项）。为规范和加强修购专款管理，提高使用效益，根据有关规定，制定了《中央级科学事业单位修缮购置专项资金管理办法》，各项目承担单位也出台了相应的管理办法。经过了9年的发展改革，中央级事业单位修缮购置专项管理制度不断完善，体现出其对国家科研单位的巨大支持作用，不断显示出该项目的先进性和影响力，取得了一定的成绩，其规模也在不断的扩大，但其管理机制问题也随之出现，要解决这些问题就应从微观层面着手，规范具体中央级科研单位修缮购置专项管理。本文以中央级农业科研单位修缮购置专项的管理为研究对象，首先从理论出发，阐述了修购专项的概念和特征，分析得出了修购专项管理机制的含义以及构成；然后根据目前中央级农业科研单位修购专项管理的基本情况，分析了修购专项在实施管理中存在的问题，以A研究所为案例分析对象，将理论研究与单位具体操作相结合，针对单位实际提出了相适应的修缮购置专项管理的对策。