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背景及意义: S期激酶相关蛋白2(S-phase kinase associated protein2,Skp2)属于 F-box蛋白家族成员,与 S期激酶相关蛋白1(S-phase kinase associated protein1,Skp1),Cullin-1,RBX1共同组成 Skp2 SCF复合体,发挥 E3泛素连接酶的作用,介导蛋白质的泛素化过程。Skp2也是一种致癌基因,它能调控细胞周期进程、细胞衰老、细胞凋亡、迁移等过程。也有研究表明 Skp2 SCF复合体在表皮细胞生长因子(Epidermal Growth Factor,EGF)的刺激下,作为蛋白激酶 B(protein kinase B,Akt)的直接 E3泛素连接酶,促进 Akt发生膜聚集和泛素化使其激活并促进癌细胞的糖酵解,而 Skp2的缺失能损伤 Akt的激活和糖酵解过程,这暗示调节Skp2的表达是控制癌细胞糖酵解过程的有效途径。最新研究也发现 Skp2在调节癌细胞干性和自我更新能力上有重要的作用。近年来竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)的越来越被接受,这假说认为 RNA之间可以通过共同微小 RNA(microRNA,miRNA)反应元件(miRNA response elements,MREs)竞争结合 miRNAs,影响游离的miRNAs水平,构成一种内源竞争的关系,实现相互调节。已知 ceRNAs的范围包括 mRNA和非编码 RNA,如假基因(pseudogenes)转录物、长链非编码(Long non-coding RNAs,LncRNAs)、环状R N A(circular RNAs,circRNAs)等。本课题组前期的合作研究结果表明,S k p2与癌细胞 G2/M期转换、多倍体和肿瘤生成密切相关。但目前的研究尚不清楚是否存在与 Skp2构成内源竞争关系的,能够调节 Skp2表达水平的RNA,以及该ceRNA是否会影响 Skp2在肿瘤发生过程中的作用。本项目拟通过 ceRNA视角鉴定 Skp2的ceRNA,及其调节 Skp2表达的模式,将为研发针对 Skp2的分子靶向药物提供新的靶点。 方法: (1)通过生物信息学方法预测 Skp2的ceRNA以及通过实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)检测 Skp2在五株肺癌细胞系和一株肺正常上皮细胞株中的 初始表达。 (2)设计合成 ceRNA的siRNA及其对应的阴性对照。用 Lipofectamine2000 siRNA分别转染 LTEP-a2,NCI-H460及 NCI-H1299细胞,运用 qRT-PCR、Western blot分析转染后,Skp2在细胞中的表达变化,用以初步筛选 Skp2的ceRNA。 (3)用双荧光素酶报告基因实验,Western blot,qRT-PCR进一步筛选出 Skp2的ceRNA以及验证 Skp2与其 ceRNA是否以3′ UTR,miRNA依赖的方式构成竞争性关系。 (4)通过生物信息学网站、双荧光素酶报告实验、Western blot,qRT-PCR预测、筛选及验证 Skp2与其 ceRNA共同的miRNAs。 (5)通过 MTT和克隆实验分析 Skp2与其 ceRNA对细胞生长和增殖的影响。 (6)通过流式细胞术分析Skp2与其 ceRNA对细胞周期和细胞凋亡的影响。 (7)通过 Western blot检测 Akt的磷酸化水平,检测 ceRNA对磷酸化 Akt的影响。 (8)通过 qRT-PCR检测肺癌组织中 Skp2与其 ceRNA的表达,分析 Skp2与其ceRNA在临床样本中的相关性。 结果: (1)在 StarBase2.0中预测到 Skp2的ceRNA有 ZFP36L2,BCL11A,PCNX,PGM2,TMEM24。Skp2在肺癌细胞 LTEP-a2中相对高表达;在 NCI-H1299,NCI-H460中相对低表达。 (2)干扰上述初步筛选的ceRNA后,检测 Skp2在蛋白水平和 mRNA水平的表达变化,进一步筛选出 Skp2的ceRNA为 ZFP36L2,PCNX,TMEM245。 (3) PCNX与 Skp2以3′UTR,miRNA依赖的方式构成竞争性关系。 (4) PCNX与 Skp2的转录物通过竞争结合 miRNA-26,miRNA-182,miRNA-340,miRNA-506,实现相互调节。 (5)干扰 PCNX与 Skp2的表达抑制肺癌细胞的生长和增殖,而过表达 PCNX与 Skp2的3′ UTR促进肺癌细胞的生长和增殖,即 PCNX与 Skp2对肺癌细胞的生长和增殖有促进作用。 (6)干扰 PCNX与 Skp2的表达阻碍肺癌细胞的周期进程、促进细胞的凋亡;而过表达 PCNX与 Skp2的3′ UTR能促进细胞的周期进程抑制细胞的凋亡,即 PCNX与 Skp2促进肺癌细胞的周期进程,抑制细胞的凋亡。 (7)干扰 PCNX能抑制由 EGF诱导的Skp2 SCF复合体调节的Akt磷酸化,且 PCNX的抑制作用因共转染 siDicer而降低。即 PCNX的转录物作为Skp2的ceRNA,可调节 Akt的磷酸化,影响 Akt的活化状态。 (8)在肺癌临床样本中,Skp2和 PCNX在癌组织中的表达均高于癌旁组织。同时,在 Skp2低表达的病例中,PCNX也低表达;Skp2高表达的病例中,PCNX也高表达。反之亦然,这暗示 Skp2和 PCNX在肺癌中可相互调节。 结论: 本研究首次在 RNA水平上筛选出 Skp2的ceRNA为 PCNX,同时阐明了PCNX与 Skp2转录物通过竞争结合 miR-26,miR-182,miR-340,miR-506构成竞争性内源 RNA,且两者的竞争关系以3′ UTR和 miRNA依赖的方式相互作用。同时 PCNX的转录物作为 Skp2的ceRNA,不仅调节 Skp2的表达,也具有与Skp2类似的生物学功能,即能促进细胞的生长、增殖、细胞周期进程以及抑制细胞凋亡。此外,PCNX还可影响 Skp2 SCF复合体调节的Akt的磷酸化状态,可能参与 Akt的信号通路。这些结果均说明,PCNX的转录物是 Skp2的ceRNA,通过作用 PCNX可以调节 Skp2的表达及其生物学功能,这为研发针对 Skp2的分子靶向药物提供了理论依据。