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胚胎发育直接影响到鱼类早期的存活率和健壮程度，因此，开展外界多种生态因子及内部主要生化成分代谢与胚胎发育之间关系的研究十分必要。本研究采用实验生态学与生物化学等方法和技术，研究了温度、盐度、pH及光照等生态因子对军曹鱼胚胎发育的影响(以受精卵总孵化率(TH)等六项统计指标来反映军曹鱼胚胎发育的结果)及军曹鱼胚胎主要生化成分在胚胎发育各主要时期的消耗利用情况，为军曹鱼规模化育苗提供一些胚胎学上的基础资料。研究结果与结论如下：
军曹鱼胚胎发育的最适生态价研究方面，实验中温度设20.0℃、22.0℃、24.0℃、26.0℃、28.0℃、30.0℃、32.0℃、34.0.℃和36.0℃等9个梯度；盐度设10.0、15.0、20.0、25.0、30.0、.35.0、40.0、45.0、50.0等9个梯度；pH设6.00、6.50、7.00、7.50、8.00、8.50、9.00、9.50、10.00等9个梯度；光照周期设0h、6h、12h、18h、24h和36h等5组；光照强度设0Lx、50Lx、100Lx、200Lx、400Lx、800Lx、1600Lx、3200Lx、6400Lx等9组。
结果表明：军曹鱼胚胎发育的适宜生态价为：水温23.5℃～29.7℃、盐度25.0～40.0、pH7.00～9.00、光照强度100Lx～1600Lx、光照周期为0～18h；其最适生态价为：水温26.7℃～28.3℃、盐度30.0～35.0、pH8.00～8.50、光照强度800Lx、光照周期12h。
军曹鱼在胚胎发育期间，对每一项生态因子都存在一个适宜及最佳生态价，随着上述生态因子的变化，孵化率等统计指标与生态因子变化均呈近似二阶曲线的关系，发育历期等与生态因子变化均呈线性的关系，这些共同特征反映了军曹鱼内部生理活动对外界生态因子变化的应答趋势，整体上体现为军曹鱼在胚胎发育期间对自然界环境逐渐变化的特殊生态对策。
军曹鱼胚胎发育过程中，含水量呈上升的趋势，受精卵期含水量仅为(86.39±1.33)％，发育到原肠期含水量高达(87.49±3.18)％；总蛋白含量逐渐下降，受精卵期的总蛋白含量最高，占样品湿重的(7.14±1.00)％，孵出时下降到6.90％；总脂含量(湿重)整体下降，最初占胚胎湿重的(4.34±0.58)％，孵出时降至(3.89±0.51)％；糖类含量(湿重)亦不断下降，其中受精卵期占湿重的1.19±0.25％降至第9期含糖量仅为湿重的(0.88±0.58)％；军曹胚胎发育各时期的比能值Q均在(3.25±0.21)～(3.54±0.86)kJ·g-1范围内，起初，Q值受精卵期最大为(3.54±0.86)kJ·g-1逐渐降低到囊胚期(3.42±0.39)kJ·g-1，之后上升到原肠期的(3.48±1.09)kJ·g-1，以后继续缓慢下降，直至出膜时为(3.25±0.21)KJ·g-1；军曹胚胎发育各时期的E/P均在(47.12±3.05)～(49.53±5.50)kJ·g-1范围内，其变趋势与比能值Q类似，与肌肉相比较，军曹鱼胚胎比能值偏低而能质比的值偏高。
总体而言，军曹鱼胚胎发育在原肠期前后存在一个过渡时期，胚胎在这个时期积累大量的主要生化成分，为下一步的快速发育作准备。因此，原肠期前后对胚胎发育是一个关键时期。