[目的]研究线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)控制区(control region)中体细胞突变(somatic mutation)与乳腺肿瘤发生发展的相关性。[方法]对来自云南昆明的28例恶性乳腺肿瘤患者的肿瘤组织及外周血和25例良性乳腺肿瘤患者的肿瘤组织及外周血mtDNA的控制区中的第一高变区(HVS-Ⅰ)及第二高变区(HVS-Ⅱ)区段进行PCR扩增及DNA测序,以修订过的剑桥标准序列Prevised Cambridge reference sequence; rCRS)为标准比对并记录突变位点,且利用系统发育的分析方法构,判断它们的单倍型类群(参照部分编码区信息)。比较其突变分布差异,揭示可能存在的肿瘤组织特有体细胞突变。[结果]28例恶性乳腺肿瘤患者mtDNA的控制区HVS-Ⅰ、HVS-Ⅱ共发现8个体细胞突变,突变频率为28.6%,包括309+CC(样本BC6)、309+C(样本BC20、样本BC26)、279Y(样本BC16)、297R(样本BC16)、214R(样本BC21)、190Y(样本BC61)和204Y(样本BC64)；而25例良性乳腺肿瘤患者中则发现2个体细胞突变,突变频率为15.4%,包括16292Y(样本BCA10)和309+CC(样本BCA12)。统计学分析发现P=0.03,表明恶性乳腺肿瘤与良性乳腺肿瘤mtDNA控制区的体细胞突变存在显著差异。本研究还发现的10个体细胞突变中有4个(40%)是D310区polyC的多态。对28例乳腺癌患者体细胞突变与肿瘤免疫组化雌孕激素受体、HER-2基因表达情况及腋窝淋巴结转移情况等进行分析,发现体细胞突变与雌激素受体阳性表达有相关性。[结论]恶性乳腺肿瘤患者mtDNA控制区的体细胞突变频率明显高于良性乳腺肿瘤患者,提示mtDNA的体细胞突变可能确实与肿瘤的发生、癌变相关；mtDNA控制区的体细胞突变可能在乳腺肿瘤的发生发展中起重要作用；在乳腺肿瘤中D310区是突变热点区域,可能与乳腺肿瘤的发生发展有着一定的联系,与以往的研究结果相符合。另外,从1ntDNA单倍型类群的角度出发,病人组和正常对照组之间的对比分析没有发现与乳腺肿瘤存在显著相关的mtDNA单倍型类群,结合其它研究结果报道,提示我们母系遗传背景在乳腺肿瘤患者中的作用可能很小。恶性乳腺肿瘤患者mtDNA控制区的体细胞突变与雌激素受体阳性表达有相关性,需增加样本量,进一步深入研究其意义。[目的]基于线粒体DNA (mtDNA)的全基因组信息研究mtDNA体细胞突变与乳腺良性疾病发生的相关性。[方法]对来自云南昆明市第一人民医院乳腺科诊治的28例良性乳腺疾病患者的病变组织mtDNA全基因组序列进行聚合酶链反应(PCR)扩增及DNA测序；以修订过的剑桥标准序列为标准比对并记录突变位点,参照东亚线粒体DNA系统发育树(phylogenetic tree)来确定其系统发育地位；通过单倍型类群(haplogroup)划分并与前期发表的mtDNA全基因组数据比较,识别出个体(或组织)特有的变异(即私有突变)及其与已报道mtDNA序列共享有的突变位点(即单倍型类群特征变异；haplogroup-diagnostic variation);通过对病人mtDNA的单倍型类群识别并将其构建系统发育关系树；通过与同一病患个体外周血mtDNA变异模式比较,揭示可能存在的乳腺良性病变组织特有的体细胞突变。[结果]研究获得了乳腺良性疾病患者病变组织mtDNA全基因组的突变图谱,并构建了系统发育关系树；28例良性乳腺疾病患者的病变组织的mtDNA全基因组信息,发现了7个体细胞变异,其中,BCA10病人16292位置存在体细胞突变,16292位于第一高变区,另外6个体细胞突变均位于mtDNA编码区中,除了1个突变(5567)位于tRNA之外,剩余5个突变均位于蛋白编码基因上,且其中4个均为非同义突变(即均引起了氨基酸变化),结果揭示,28例患者的mtDNA分别归属为单倍型类群M7b、M7c2、C、D4b2b、D4i、D4k、D5a2、D5b、G1、R9b、F1、B5b、B4c2a、 B4d、R11、R22及N9a。[结论]本课题对28例良性乳腺疾病患者病变组织的mtDNA全基因组信息进行了研究,结果发现7个体细胞突变,1个位于控制区而另外6个均位于编码区,且存在于：mtDNA编码区区段中的体细胞突变大部分(4/6)均为非同义突变,会引发编码氨基酸的变化,提示这些mtDNA突变在乳腺良性疾病的发生、发展中可能存在潜在的作用。过去的相关研究仅仅基于mtDNA控制区片段的研究,所揭示的信息显然非常有限,而本课题的研究是基于全基因组信息对mtDNA在乳腺疾病发生发展过程中发挥的作用有较系统而深入的了解。可引发氨基酸变化的肿瘤特异体细胞的突变,在疾病发生发展过程中可能起着重要作用,这些mtDNA突变也可能为将来乳腺肿瘤的临床诊断提供潜在有价值的遗传标记。伴有乳腺癌高危因素的乳腺良性疾病患者,mtDNA的体细胞突变高于没有乳腺癌高危因素的乳腺良性疾病患者,为乳腺癌的患病风险,提供一项新的依据。但因研究样本量太少,还有待进一步研究。