近年来，针对南四湖生态环境严重受损状况及南水北调水污染治理的需要，山东省加快建设水污染治理项目，水质得到一定改善。从2012年4月到11月份对南四湖大型底栖动物进行了采集，并对其物种数、优势种、密度和生物量的空间及时间变化、大型底栖动物群落结构及其多样性、水体理化因子与大型底栖动物相关性分析及水质污染情况进行了初步研究。根据南四湖水文状况等环境特征，本次研究于南四湖共布设11个采样点，分别于2012年春季（4月）、夏季（6月）、秋季（8月）到2012年冬季（11月）对其进行4次采样。采样分为定量采集和定性采集两种方法。定量采集、定性采集每样地分别采集平行样三个。将采得的样品带回实验室经网筛过滤分捡，然后进行分类鉴定，统计数量和测定生物量；利用物种组成、密度、生物量分析群落的空间差异和时间差异；运用生物多样性指数和相似性指数对群落进行多样性分析；对环境因子和三种动物种类数、密度进行相关性分析；采用水体监测水质评价和利用Shannon-wiener物种多样性指数、 Pielou均匀度指数、Margalef种类丰富度指数、BPI-Biology Pollution Index生物学污染指数四种生物指数进行水质生物评价。1、本次调查，共采集到大型底栖无脊椎动物5108只，有50种，隶属于4门20科41属。主要有三大类：软体动物、水栖寡毛类、水生昆虫，其中软体动物20属23种，水栖寡毛类7属10种，水生昆虫10属13种，其它4属4种。软体动物（主要为螺类）、水栖寡毛类（主要为水丝蚓）、水生昆虫(主要为摇蚊幼虫)个体数占比例分别为66.249%、23.3164%、10.239%；其它的仅占0.196%。软体动物为最稳定最主要的类群。2、分析南四湖各样点物种种类数，三个入湖口种类较少，房庄河种类数最少，仅有10种；新薛河15种；洙赵新河17种；其余采样点物种数较多，且种类数相差不大，都在20种以上，其中微山湖11号采样点种类数最多，为27种。物种以水生昆虫、软体动物、水栖寡毛类为主，软体动物种类数最多。随季节的变化，物种组成变化不大。3、南四湖优势种有纹沼螺、槲豆螺和水丝蚓属一种。纹沼螺在9个样点中存在，在独山湖及微山湖较多；槲豆螺分布最广，在11个样点中都存在，微山湖最多，而在三个入湖口很少，都不足10头；水丝蚓属在9个样点中存在，但是各个样点中数量差异很大，南阳湖数量最多，占到各物种总数量的45％，其次为洙赵新河，水丝蚓属占到各物种总数量的88%，而其他样点中数量很少。4、南四湖大型底栖动物密度及生物量的时间变化及空间变化差异均很大。春夏秋冬四季三类动物的密度大小均为软体动物>水栖寡毛类>水生昆虫，生物量大小均为软体动物>水生昆虫>水栖寡毛类；南四湖大型底栖动物各个季节在各个采样点分布差异很大，除夏季外，春、秋、冬季水生昆虫、水栖寡毛类密度均以南阳湖含量最多，其次为洙赵新河，8号采样点密度也较大；软体动物除春季外，夏、秋、冬季均以微山湖11号采样最大，各个季节中5、6、10号采样点密度也较大，2、3、8、9号采样点密度都很小。生物量分布规律与密度大致相同。5、南四湖大型底栖动物多样性指数值在各个采样点存在着一定的差异，洙赵新河Shannon-wiener物种多样性指数、Pielou均匀度指数较小，其它采样点较大且相差不大。Margalef种类丰富度指数在房庄河最小，新薛河最大，3至9号采样点依次增大，10、11号采样点略小于7、8、9号采样点。Pielou均匀度指数季节变化相比于其它两个指数较小，Shannon-wiener物种多样性指数、Margalef种类丰富度指数各个采样点的变化规律相差较大。各个采样点群落相似性系数不大。6、分析大型底栖动物与水质理化因子的相关性，水生昆虫及软体动物种类数及密度都与温度呈现负相关性，水栖寡毛类种类数、密度与温度呈正相关性。水生昆虫及水栖寡类密度与溶氧量呈负相关性，水生昆虫及水栖寡毛类种类数及软体动物密度和种类数都与溶氧量呈正相关性，尤其是软体动物及水栖寡毛类与溶氧量呈显著正相关性。三类大型底栖动物种类数及密度与TN、TP、CODMn大部分呈负相关性，少数呈正相关性，相关性不显著。水栖寡毛类的种类数与TN、TP、CODMn三类指标都呈显著性相关性，说明富营养化水体有利于水栖寡毛类的生长，水栖寡毛类可以指示水体受污染的程度。7、通过测量水质理化指标得出入湖河流房庄河水质总体处于Ⅲ-Ⅴ类，新薛河、洙赵新河水质总体为Ⅱ-Ⅲ类，湖区水质除南阳湖TN评价为Ⅴ类外，其他指标评价独山湖、昭阳湖、微山湖水质为Ⅰ-Ⅲ类，且Ⅰ-Ⅱ类占多数。通过大型底栖动物生物指数评价显示房庄河水质为重污染，洙赵新河水质为中污染，其他采样点除了微山湖11号采样点为轻污染外其它的都为轻中污染。