基于核酸适配体或纸喷雾离子化质谱技术建立结直肠癌外泌体快速检测方法

来源 :中国人民解放军海军军医大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Hawk8
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结直肠癌是消化道常见肿瘤,近年来发病率有上升趋势。虽然粪隐血实验、结肠镜检等检查提高了结直肠癌的诊断率,但是,非侵入性的液体活检技术仍是早期发现结直肠癌、降低结直肠癌相关死亡率的预期诊断策略。目前大多数筛查方法都不足以取代传统的结直肠癌诊断方法(直肠指诊、影像学检查、结肠镜检查、病理检查),且癌胚抗原(CEA)作为疾病诊断标志物,对早期肿瘤的诊断价值不大。随着技术的进步及对癌症相关分子的深入研究,外泌体被认为是一种潜在的新型生物标志物。外泌体是一种直径30-200 nm的微囊泡,细胞通过内质网传递、胞吐等过程将外泌体释放到外周血、尿液、唾液、组织液等体液中。外泌体因其囊泡样结构携带大量生物分子,其中包括能够反映和代表宿主细胞来源的核酸和蛋白质。而且,癌细胞释放出的外泌体具有特异性的遗传信息和表观遗传修饰,使其在信号传递、肿瘤转移等方面发挥重要作用。结直肠癌肿瘤细胞在分泌外泌体的过程中,在外泌体表面、囊泡内都组装了结直肠癌细胞特异性的分子,如A33(vaccinia virus antigen)、上皮细胞黏附分子(epithelial cell adhesion molecule,EpCAM)、CEA等。从临床检测角度分析,携带有肿瘤特异性分子的外泌体,因其广泛分布于各种体液中,因此可以作为液体活检的新型检测标志物,应用于非侵入性的临床诊断操作。但是外泌体为纳米级结构,且肿瘤早期其在外周血中的数量相对较少,现有的常规临床检测方法很难对外泌体进行分离、富集和精确的定量检测,因此,建立快速、灵敏的外泌体检测方法是目前的研究需要。(一)新型纳米材料在微量检测中的应用越来越广,其中氧化石墨烯因其良好的生物相容性、比表面积大等特性,已被大量用于生物分子、活细胞检测。适配体是寡核苷酸单链,能够特异性地与检测目标(包括小分子化合物、蛋白、活细胞及外泌体等)结合,具有亲和力高、特异性强、可对其进行多种化学修饰等优点,氧化石墨烯能够与适配体通过分子间相互作用力结合,从而引起相关化学特性的改变。目前已有多项研究利用GO及适配体进行小分子化合物及活细胞的检测。但是,氧化石墨烯与荧光DNA单链适配体相互作用的方法在外泌体检测中还未有报道。本文在第一部分建立了一个基于氧化石墨烯与荧光DNA单链适配体相互作用的结直肠癌外泌体快速荧光检测方法,以结直肠癌外泌体特异性蛋白CD63和EpCAM为联合检测靶点,该体系利用荧光DNA单链适配体-GO复合体为探针,在与结直肠癌外泌体相互作用的过程中,复合体发生构象变化,GO对荧光DNA单链适配体的吸附和解离导致荧光猝灭和荧光恢复,通过荧光强度变化可对结直肠癌外泌体进行定量检测。实验过程中我们对反应条件及体系进行了优化,并以脱氧核糖核酸酶为工具酶,对荧光信号进行放大,最终得到对结直肠癌外泌体检测灵敏度达到2.1×10~4 particles/ml的检测方法,该检测可在30分钟内完成。用19例临床血清样本(5ml)对该方法进行验证,其可有效区分健康对照和结直肠癌患者(P<0.05),证明该方法在临床实验室检测中具有潜在的应用价值。但是,该检测体系选择的检测靶点为EpCAM,EpCAM在胰腺癌、乳腺癌等肿瘤外泌体中也过量表达,因此该方法的特异性有待进一步提高。在下一步研究中,本课题将针对检测的特异性及灵敏度进行改进。(二)质谱检测具有灵敏度高、检测动态范围广、特异性强等特性,目前已被广泛应用于疾病诊断、微生物检测、药物分析等领域。为简化质谱检测方法,一些新型的常压电离方法已被开发出来,如纸喷雾电离技术。纸喷雾电离质谱检测具有高效、简便、无需对样品进行前处理等优点,但是在对生物样本进行检测时,因无样本前处理步骤,而生物样本内容物复杂,其他离子或蛋白质等分子会抑制待测物的信号,导致灵敏度较差。生物大分子因其分子量大,直接进行质谱分析时所得数据量大,不易分析。若在生物大分子上标记反应可逆的小分子化合物,通过检测小分子化合物间接对生物大分子进行定量分析,可极大提高检测效果。为进一步提高结直肠癌外泌体的检测灵敏度,本文在第二部分建立了一种基于免疫反应的接触式纸喷雾离子化质谱检测方法,用于检测样品中的结直肠癌外泌体。该方法构建了一个双层纸芯片用于样品前处理,用免疫方法对外泌体进行捕获,捕获抗体为抗CD63抗体,从而实现外泌体的纯化与富集;并且构建了两种可裂解的小分子离子探针(DMG-probe,DPA-probe),用离子探针对外泌体特异性检测抗体抗A33抗体进行标记,离子探针被裂解后进入质谱仪完成检测。本实验利用纸芯片实现了免疫反应与纸喷雾检测小分子离子探针的集成分析,DMG-probe和DPA-probe对结直肠癌外泌体的最低检测浓度分别为1.7×10~2 particles/ml和2.5×10~2 particles/ml,其灵敏度是第一部分氧化石墨烯方法的100倍。而且,该纸芯片可对捕获的外泌体样本进行长期有效保存(30天),因此可用于患者自助式分析,即患者在家中或其他场所完成纸芯片上的免疫反应,然后将纸芯片送至质谱检测机构进行检测。本文分别利用新型纳米材料和纸喷雾离子化质谱方法建立了两种结直肠癌外泌体快速检测平台,两种方法均具有快速、方便、高灵敏度的特点,在肿瘤外泌体的临床诊断中具有很大的应用前景。
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