本文第一部分以10个甲型流感病毒北美毒株的基因PB2,PB1,PA,HA,NP,NA,NS和M进行遗传进化分析,并用不同的软件对PB2,HA,NS1和M2蛋白氨基酸序列、糖基化位点及抗药性位点分析。结果表明,甲型流感病毒北美毒株的基因片段是一个来源于不同宿主、不同地域的重组株。HA蛋白氨基酸序列分析表明,北美毒株HA蛋白的裂解位点氨基酸序列均为IPSIQSR↓G,不具有高致病性流感病毒的特性,同时NS1蛋白第92位氨基酸残基由天冬氨酸突变为谷氨酸(Asp→Glu),PB2蛋白氨基酸序列的第627位均为谷氨酸(E),这些特性表明对人具有明显的亲和性,但推测对人具有较低的致病力。M2蛋白的同源建模表明了北美毒株M2蛋白的药物敏感位点突变为抗药型位点,推测北美毒株具有抗金刚烷胺类药物的结构特点,NA蛋白序列分析表明了北美毒株仍然对神经氨酸酶抑制剂类药物敏感。这些研究结果对于我国预防和控制甲型流感北美毒株具有重要的参考价值。本文第二部分对A型H5N1亚型高致病性禽流感病毒(HPAI H5N1)的进化模式进行了分析、探讨。HPAI H5N1是一种禽类流行传染病,目前只有少量的证据表明它能进行人际传染。现在全球都在努力控制和消灭禽类中的H5N1流感病毒,并防止人直接暴露在病毒面前,所有的努力都是为了避免H5N1病毒在人类间造成大规模的流行。我们使用了215株人源H5N1禽流感的血凝素基因(HA)序列来追踪病毒的起源和揭示病毒的全球传播模式。HA序列的突变网络和遗传进化分析都表明了所有这215株病毒都可以分成4个类群,这与病毒的地理分布是相一致的。依据HA蛋白的第100和第170位N-糖基化位点的情况也可以将病毒分为三种类型。经过遗传进化和地理信息系统(GIS)数据综合分析,我们发现中国南方是人源H5N1流感病毒的起源地,以及每个病毒类群的分布模式和进化特征。总之,目前的遗传学证据表明中国南方就是人源H5N1病毒的最初起源地。