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目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)的复制水平、基因型及其S、P区变异对乙型肝炎(乙肝)疫苗阻断母婴传播效果的影响。方法:采集37对乙肝疫苗免疫失败的母婴配对血清74份,以及41对阻断成功的母亲血清41份,以酶联免疫吸附法(ELISA)和微粒免疫技术(MEIA)作乙肝三系检测,以特异性引物聚合酶链反应(PCR)或套式PCR(nest-PCR)扩增HBV P、S区基因,进而通过DNASTAR软件,分析免疫失败母婴HBV基因型以及HBV S、P区基因的变异性,并以实时荧光定量PCR检测所有免疫失败母婴及免疫成功母亲血清HBV载量。结果:(1)HBV S区PCR产物电泳阳性率:37例阻断失败母亲为83.78%(31/37);37例阻断失败儿童为43.24%(16/37);41例阻断成功母亲为60.98%(25/41)。(2)平均HBV DNA载量:阻断失败母亲、阻断失败儿童、阻断成功母亲分别是4.17×10~7、6.65×10~7、8.40×10~6,在阻断成功母亲组与阻断失败母亲组之间存在明显差异(P=0.023),而在阻断失败母婴之间不存在统计学差异(P=0.380),也不存在线性关系(P=0.08)。(3)母婴配对HBV S基因同源性:阻断失败母婴配对的HBV S基因同源性在99.5%以上。(4)HBV基因型组成:阻断成功母亲与阻断失败母亲均以C基因型为主,其检出率阻断失败母亲组高于阻断成功母亲组,但无统计学意义(P=0.071)。(5)HBV“a”决定簇存在多个变异位点:在阻断失败儿童中检出G145R、G145A变异,在阻断失败母亲中检出T123A、G145R变异,在阻断成功母亲中则检出T126N、T126S、T143N、D144A、D144G变异。(6)HBV P基因变异性:检测23例阻断失败母亲及9例阻断成功母亲的HBV P基因区序列,没有发现变异位点。结论:(1)HBV DNA的高拷贝是乙肝疫苗阻断母婴垂直传播失败的高危因素。(2)配对母婴之间的HBV病毒株S基因高度同源,提示儿童感染HBV来自垂直传播。(3)感染的HBV基因型与乙肝疫苗免疫阻断成功与否无明显相关;(4)HBV“a”决定簇存在多个位点的变异,其中G145R、G145A变异存在于阻断失败儿童,T123A、G145R变异存在于阻断失败母亲,是否与乙肝疫苗免疫失败相关有待进一步研究;T126N、T126S、T143N、D144A、D144G变异存在于阻断成功母亲,不影响目前乙肝疫苗的免疫效果;(5)HBV P基因变异与乙肝疫苗免疫阻断成功与否无明显相关。