1987年,中国诞生了首家科技企业孵化器。30多年来,科技企业孵化器在贯彻落实国家相关创新创业政策,连接创新资源、扶持创新主体、促进科技成果等方面发挥了重要作用,培养了一批优秀的企业和企业家,已发展成为国家实施创新驱动发展战略的重要组成部分。本文在科技企业孵化器的研究现状、相关理论分析,对绩效概念界定及国家科技企业孵化器认定标准阐述,研判科技企业孵化器发展现状的基础上,提出孵化器数量分布不平衡、孵化器区域发展差距显著、优秀孵化器数量占比偏少、孵化器服务能力较弱、孵化器绩效评价不完善等问题。其次,选取21个孵化器绩效影响因素指标进行主成分分析,计算国家级孵化器综合评价得分,采用变异系数法对指标进行权重设置。根据孵化器绩效影响因素相关研究、绩效影响因素的主成分分析结果以及指标的重要性程度,考虑指标的可获得性和准确性,从投入和产出角度,构建科技企业孵化器绩效评价指标体系,包括人力资源、财力资源、基础设施、经济效益、社会效益和孵化效益6个二级指标,10个三级指标。采用投入导向的BCC模型和超效率DEA模型对30个省市地区的国家级科技企业孵化器绩效水平进行横向分析评价,再从纵向角度评价分析国家级科技企业孵化器的运行效率情况。最后提出科技企业孵化器绩效提升的措施:优化内外部资源配置,推动区域协调发展;建立项目入驻筛选机制,完善企业孵化流程;构建创业孵化服务体系,提高孵化质量和效益;提高项目投融资覆盖率,推进投资孵化相融合;加强政府政策引导支持,营造良好创新创业氛围;完善孵化器绩效评价内容,构建入孵企业成长评价体系。