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研究目的:
肝细胞癌((Hepatocellularcarcinoma,HCC)是全球第五大常见癌症,也是导致癌症相关死亡的第二大原因。肝癌转移是其高复发率和不良预后的主要原因,手术切除和肝移植是目前临床上治疗肝癌的最佳选择,但治疗效果不佳。因此,揭示肝癌转移的发病机制具有重要的医学意义。
Sirtuins(SIRTs)是第Ⅲ类组蛋白去乙酰化酶,在调节酵母、蠕虫和苍蝇的寿命方面发挥重要作用。其中,Sirtuin5(SIRT5)因其独特的蛋白翻译后修饰(post-translationalmodification,PTM)活性和生化生理功能成为研究热点。SIRT5通过去乙酰化并激活氨甲酰磷酸合成酶1(carbamoylphosphatesynthetase1,CPS1)调节尿素循环。SIRT5还可以去乙酰化FOXO3,减少肺上皮细胞的凋亡。研究发现SIRT5在多种癌症中表达异常、功能各异,SIRT5在肿瘤进展中所发挥的作用得到越来越多的关注,但其在HCC中的作用仍不清楚。
中间纤维是真核细胞细胞骨架的主要组成部分。Vimentin为Ⅲ型中间纤维蛋白(Intermediatefilament,IF),是IF蛋白家族中最为保守和丰富的蛋白之一。Vimentin在肿瘤细胞中的表达被认为是上皮间充质转化(epithelialalmesenchymaltransition,EMT)的标志之一,与细胞侵袭和预后不良有关。Vimentin有各种功能重要的蛋白翻译后修饰,如磷酸化、糖基化、类泛素化和ADP核糖基化等翻译后修饰来执行其功能。然而,vimentin的其他修饰(如乙酰化)是否参与肝癌EMT过程尚不清楚。我们猜想SIRT5是否通过其去乙酰化酶学活性作用于Vimentin,在肝癌的转移过程发挥一定作用?因此,本研究旨在探讨SIRT5和vimentin乙酰化在肝癌中的作用。
实验方法:
1.从TCGA数据库的肝细胞癌数据集下载了424例HCC患者的RNAseq数据。分析并比较了SIRT5在374例肝癌和50例癌旁中的mRNA表达水平。
2.我们收集了19例肝癌患者的组织样本,采用Westernblot实验检测了SIRT5在肝癌和癌旁组织中的蛋白的表达。
3.为了研究SIRT5的细胞生物学功能,采用transwell和划痕实验,观察SIRT5对细胞迁移能力的影响。
4.构建SIRT5-shRNA慢病毒表达载体,感染SNU449细胞,用嘌呤霉素筛选稳定感染了SIRT5-shRNA和Scramble-shRNA的细胞,提取细胞总蛋白,Westernblot检测SIRT5的敲降效果。
5.将稳定转染SIRT5-shRNA和Scramble-shRNA的SNU449细胞接种于裸鼠皮下,建立皮下移植瘤模型。观察肿瘤生长情况、绘制肿瘤生长曲线,取下瘤体石蜡包埋、切片后HE染色。
6.通过尾静脉注射法建立裸鼠模型,两组裸鼠分别注射稳定转染SIRT5-shRNA和Scramble-shRNA的SNU449肝癌细胞。
7.苏木素-伊红染色(hematoxylin-eosinstaining,HE染色)用于制作裸鼠肝、肺组织病理切片染色,明确各组裸鼠的肝、肺转移的病理诊断,并进行区分对比各组肝、肺转移的情况。
8.利用Westernblot法检测HCC细胞敲减SIRT5后相关EMT蛋白标志物的表达。
9.利用Co-IP的方法验证SIRT5与Vimentin的相互作用。
10.利用液相色谱-质谱(LC/MC)方法鉴定Vimentin乙酰化修饰位点。
11.从TCGA数据库的肝细胞癌数据集下载了424例HCC患者的RNAseq数据。比较vimentin在374例肝癌和50例癌旁中的mRNA表达水平,并分析SIRT5与vimentinmRNA水平的相关性。
12.按照MutExpressIIFastMutagenesiskitV2点突变试剂盒方法将质粒Vimentin(WT)突变成Vimemtin(K120R)、Vimemtin(K120Q),质粒SIRT5(WT)突变为SIRT5(H158Y),测序确认突变成功。细胞转染相应的质粒后,通过transwell实验验证SIRT5降低导致Vimentin的乙酰化对细胞迁移的影响。
结果:
1.TCGA数据库RNAseq分析结果显示,SIRT5在肝癌组织的mRNA水平显著下调(*P<0.05),SIRT5低表达患者预后差(**P<0.01)。
2.临床样本结果显示,与癌旁相比,SIRT5的蛋白表达在肝癌组织中显著降低(*P<0.05)。
3.Transwell和划痕实验证明,与对照相比,下调SIRT5,SNU449和HepG2细胞的迁移能力显著加强(*P<0.05);反之,与对照相比,过表达SIRT5,7402细胞迁移能力显著下降(*P<0.05)。
4.经病毒感染条件摸索,慢病毒在MOI值为120且用ENi.S.替代常规培养基时病毒对SNU449细胞的感染效率达80%以上,且细胞状态良好,确定为病毒的最佳感染条件。经Westernblot实验验证,与Scramble-shRNA对照组相比,SIRT5-shRNA慢病毒组SNU449细胞中SIRT5蛋白表达明显下调。
5.裸鼠皮下成瘤实验证明,实验组(SNU449稳转SIRT5-shRNA慢病毒)小鼠皮下成瘤大小与对照组(Scramble-shRNA)相比无明显差异,差别无统计学意义(P>0.05)。
6.在裸鼠转移模型,HE染色发现,与对照组相比,实验组小鼠肝组织中的转移灶面积增大,转移灶数量显著增多,差别有统计学意义(*P<0.05)。小鼠肺部未见转移灶。
7.SIRT5的下调促进了EMT相关蛋白的表达,表现为EMT相关转录因子Snail表达上升(*P<0.05)、EMT上皮标志物E-cadherin表达下降(*P<0.05);而过表达SIRT5,Snail表达下降(*P<0.05)、E-cadherin表达升高(*P<0.05)。
8.Co-IP实验证明SIRT5与Vimentin相互结合。
9.通过LC/MC鉴定,与对照相比,下调SIRT5后,Vimentin的第120位赖氨酸发生乙酰化修饰。
10.TCGA数据库RNAseq分析结果显示,Vimentin在肝癌组织的mRNA水平显著升高(*P<0.05),SIRT5与Vimentin在mRNA表达水平显著负相关(r=-0.319,**P=0.000)。
11.Transwell实验证明,下调SIRT5并过表达vimentin(WT)和vimentin(K120Q)均促进细胞迁移,而Vimentin(K120R)则抑制SNU449细胞迁移。过表达SIRT5(WT)能够逆转过表达Vimentin(WT)对BEL-7402细胞促迁移作用,但SIRT5(H158Y)却不能逆转;同样地,过表达SIRT5(WT)不能逆转Vimentin(K120R)对细胞迁移的影响。
结论:
综上所述,与癌旁相比,SIRT5在肝细胞癌组织中低表达。SIRT5下调导致的Vimentin第120位赖氨酸乙酰化在促进肝癌迁移的过程中起着关键作用。
肝细胞癌((Hepatocellularcarcinoma,HCC)是全球第五大常见癌症,也是导致癌症相关死亡的第二大原因。肝癌转移是其高复发率和不良预后的主要原因,手术切除和肝移植是目前临床上治疗肝癌的最佳选择,但治疗效果不佳。因此,揭示肝癌转移的发病机制具有重要的医学意义。
Sirtuins(SIRTs)是第Ⅲ类组蛋白去乙酰化酶,在调节酵母、蠕虫和苍蝇的寿命方面发挥重要作用。其中,Sirtuin5(SIRT5)因其独特的蛋白翻译后修饰(post-translationalmodification,PTM)活性和生化生理功能成为研究热点。SIRT5通过去乙酰化并激活氨甲酰磷酸合成酶1(carbamoylphosphatesynthetase1,CPS1)调节尿素循环。SIRT5还可以去乙酰化FOXO3,减少肺上皮细胞的凋亡。研究发现SIRT5在多种癌症中表达异常、功能各异,SIRT5在肿瘤进展中所发挥的作用得到越来越多的关注,但其在HCC中的作用仍不清楚。
中间纤维是真核细胞细胞骨架的主要组成部分。Vimentin为Ⅲ型中间纤维蛋白(Intermediatefilament,IF),是IF蛋白家族中最为保守和丰富的蛋白之一。Vimentin在肿瘤细胞中的表达被认为是上皮间充质转化(epithelialalmesenchymaltransition,EMT)的标志之一,与细胞侵袭和预后不良有关。Vimentin有各种功能重要的蛋白翻译后修饰,如磷酸化、糖基化、类泛素化和ADP核糖基化等翻译后修饰来执行其功能。然而,vimentin的其他修饰(如乙酰化)是否参与肝癌EMT过程尚不清楚。我们猜想SIRT5是否通过其去乙酰化酶学活性作用于Vimentin,在肝癌的转移过程发挥一定作用?因此,本研究旨在探讨SIRT5和vimentin乙酰化在肝癌中的作用。
实验方法:
1.从TCGA数据库的肝细胞癌数据集下载了424例HCC患者的RNAseq数据。分析并比较了SIRT5在374例肝癌和50例癌旁中的mRNA表达水平。
2.我们收集了19例肝癌患者的组织样本,采用Westernblot实验检测了SIRT5在肝癌和癌旁组织中的蛋白的表达。
3.为了研究SIRT5的细胞生物学功能,采用transwell和划痕实验,观察SIRT5对细胞迁移能力的影响。
4.构建SIRT5-shRNA慢病毒表达载体,感染SNU449细胞,用嘌呤霉素筛选稳定感染了SIRT5-shRNA和Scramble-shRNA的细胞,提取细胞总蛋白,Westernblot检测SIRT5的敲降效果。
5.将稳定转染SIRT5-shRNA和Scramble-shRNA的SNU449细胞接种于裸鼠皮下,建立皮下移植瘤模型。观察肿瘤生长情况、绘制肿瘤生长曲线,取下瘤体石蜡包埋、切片后HE染色。
6.通过尾静脉注射法建立裸鼠模型,两组裸鼠分别注射稳定转染SIRT5-shRNA和Scramble-shRNA的SNU449肝癌细胞。
7.苏木素-伊红染色(hematoxylin-eosinstaining,HE染色)用于制作裸鼠肝、肺组织病理切片染色,明确各组裸鼠的肝、肺转移的病理诊断,并进行区分对比各组肝、肺转移的情况。
8.利用Westernblot法检测HCC细胞敲减SIRT5后相关EMT蛋白标志物的表达。
9.利用Co-IP的方法验证SIRT5与Vimentin的相互作用。
10.利用液相色谱-质谱(LC/MC)方法鉴定Vimentin乙酰化修饰位点。
11.从TCGA数据库的肝细胞癌数据集下载了424例HCC患者的RNAseq数据。比较vimentin在374例肝癌和50例癌旁中的mRNA表达水平,并分析SIRT5与vimentinmRNA水平的相关性。
12.按照MutExpressIIFastMutagenesiskitV2点突变试剂盒方法将质粒Vimentin(WT)突变成Vimemtin(K120R)、Vimemtin(K120Q),质粒SIRT5(WT)突变为SIRT5(H158Y),测序确认突变成功。细胞转染相应的质粒后,通过transwell实验验证SIRT5降低导致Vimentin的乙酰化对细胞迁移的影响。
结果:
1.TCGA数据库RNAseq分析结果显示,SIRT5在肝癌组织的mRNA水平显著下调(*P<0.05),SIRT5低表达患者预后差(**P<0.01)。
2.临床样本结果显示,与癌旁相比,SIRT5的蛋白表达在肝癌组织中显著降低(*P<0.05)。
3.Transwell和划痕实验证明,与对照相比,下调SIRT5,SNU449和HepG2细胞的迁移能力显著加强(*P<0.05);反之,与对照相比,过表达SIRT5,7402细胞迁移能力显著下降(*P<0.05)。
4.经病毒感染条件摸索,慢病毒在MOI值为120且用ENi.S.替代常规培养基时病毒对SNU449细胞的感染效率达80%以上,且细胞状态良好,确定为病毒的最佳感染条件。经Westernblot实验验证,与Scramble-shRNA对照组相比,SIRT5-shRNA慢病毒组SNU449细胞中SIRT5蛋白表达明显下调。
5.裸鼠皮下成瘤实验证明,实验组(SNU449稳转SIRT5-shRNA慢病毒)小鼠皮下成瘤大小与对照组(Scramble-shRNA)相比无明显差异,差别无统计学意义(P>0.05)。
6.在裸鼠转移模型,HE染色发现,与对照组相比,实验组小鼠肝组织中的转移灶面积增大,转移灶数量显著增多,差别有统计学意义(*P<0.05)。小鼠肺部未见转移灶。
7.SIRT5的下调促进了EMT相关蛋白的表达,表现为EMT相关转录因子Snail表达上升(*P<0.05)、EMT上皮标志物E-cadherin表达下降(*P<0.05);而过表达SIRT5,Snail表达下降(*P<0.05)、E-cadherin表达升高(*P<0.05)。
8.Co-IP实验证明SIRT5与Vimentin相互结合。
9.通过LC/MC鉴定,与对照相比,下调SIRT5后,Vimentin的第120位赖氨酸发生乙酰化修饰。
10.TCGA数据库RNAseq分析结果显示,Vimentin在肝癌组织的mRNA水平显著升高(*P<0.05),SIRT5与Vimentin在mRNA表达水平显著负相关(r=-0.319,**P=0.000)。
11.Transwell实验证明,下调SIRT5并过表达vimentin(WT)和vimentin(K120Q)均促进细胞迁移,而Vimentin(K120R)则抑制SNU449细胞迁移。过表达SIRT5(WT)能够逆转过表达Vimentin(WT)对BEL-7402细胞促迁移作用,但SIRT5(H158Y)却不能逆转;同样地,过表达SIRT5(WT)不能逆转Vimentin(K120R)对细胞迁移的影响。
结论:
综上所述,与癌旁相比,SIRT5在肝细胞癌组织中低表达。SIRT5下调导致的Vimentin第120位赖氨酸乙酰化在促进肝癌迁移的过程中起着关键作用。