在“大众创新,万众创业”的时代背景下,我国创新型企业快速崛起,正逐渐占据我国经济发展力量的重要地位。与此同时,创新型企业治理也正面临着许多挑战。其中一个关键问题就是在公司治理结构中如何协调创始人与机构投资者之间的关系。一方面,在创新型企业创立到发展的过程中,创业团队积累了大量的管理经验、声誉以及社会资本等相关资源,因此创业团队获得控制权有利于公司的良好发展;另一方面,在创新型企业中,机构投资者通常持有较高比例的股份,放弃公司话语权往往显得不情不愿。因此,研究这一问题需要从理论上阐释股权结构在创新型企业的治理作用,从实践中研究股权结构的治理效果。本文首先对创新型企业的股东特征对股权结构及其治理的影响进行了分析讨论,然后结合京东实行双层股权结构的创新型企业的典型案例,通过对京东实行双层股权结构的动机、特征、影响以及治理效果的分析,研究得出在创新型企业中,双层股权结构一定程度上能够解决创始人和外部股东的控制权冲突问题,协调创始人和外部股东之间的利益关系,并进而改善公司治理结构,形成创始人管理控制、机构投资者监督的有利局面。本文从股东特征的角度深化了对双层股权结构的认识,也为创新型企业的“融资与控制权维持”矛盾困境提供了一定的现实启示意义。