DNA损伤过程中产生应答的一类长链非编码RNA——vlincRNAs的功能鉴定

来源 :华侨大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fanhaoguohuifang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大规模基因组测序表明,人类基因组中只有约2%的是编码蛋白质的基因,绝大多数的都是非编码转录产物(non-coding RNA,ncRNA)。Non-coding RNA根据分子链长度可进一步分为小于200nt的短链非编码RNA(small non-coding RNA,sncRNA)和大于200nt的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。近年来大量的lncRNAs被发现报道,研究表明lncRNAs能参与调控机体的DNA损伤,DNA复制,细胞增殖,细胞分化,细胞凋亡等多种功能,众多生物学家认为lncRNAs具有丰富的生物学特性对于癌症发病机制研究和癌症治疗方案提供新的思路。  本文运用第三代单分子测序技术(single molecule sequencing,SMS),对DNA损伤诱导剂处理后的K562细胞系做 RNA测序,从而筛选出一种特殊的lncRNA。这是种位于基因间的超长非编码RNA(very long intergenic non-coding RNA,vlincRNA),普遍链长度超过50kb。已有文章表明,部分vlincRNAs的启动子位于长末端重复序列区间(LTR),这一部分包含有内源性逆转录病毒序列,这种具有LTR导向的vlincRNAs在胚胎干细胞和癌细胞中十分富集,已有实验证明用RNAi干扰技术沉默某些vlincRNAs能引起癌症细胞凋亡。  因此,本课题利用SMS和Genome Map等方法,对测序后的vlincRNAs表达数据结果反复筛选,筛选出Vlinc KVURN1,Vlinc KVDRN2,Vlinc KVURN3,Vlinc KVDRN4这四条比较有意义的vlincRNAs,并且这四条vlincRNAs都含有LTR-Promoter。多组实时定量PCR实验结果显示,药物处理K562细胞,这四种vlincRNAs在SN-38和Etoposide(VP-16)这两种拓扑异构酶抑制剂的影响效果最为明显,与测序结果完全一致。Gene Ontology(GO)注释结果表明,四条vlincRNAs的大多数功能与DNA损伤、核酸复制、细胞周期和细胞凋亡等细胞活动密切相关。
其他文献
贵金属纳米颗粒由于其具有催化、等离子体共振、光谱学等特有性质而成为无机纳米材料中研究最广泛的胶体体系之一。随着合成形貌可控的纳米材料技术的不断发展和更新,研究形
苯并嗯嗪是在酚醛树脂的基础上发展的一类新型热固型树脂,它具备传统酚醛树脂所有优点,如优异的机械性能,良好的化学稳定性、样品尺寸稳定性,较高化学电阻率、热稳定性,并且相应
橡胶是国民经济及日常生活中不可或缺的一种能产生可回复性大形变的软物质材料,现已被广泛应用于轮胎、密封、减震、制鞋等行业领域。由于未经增强橡胶的力学性能差,绝大多数情况下必须对橡胶进行增强才能满足应用所需。本课题主要采用制备多重交联网络橡胶的办法来增强橡胶材料,延长橡胶材料的使用寿命,以及为新橡胶材料的开发提供基础。本文第一部分研究不同含量硅烷偶联剂改性白炭黑填充丁苯橡胶的性能,硅烷偶联剂既能与白炭
学位
中国古代文化是古文明中一颗闪耀的明星,以一直延绵不断的精神流传至今。而雕塑作为中国古代文化的一种,更是深深刻上了传统思想的烙印。当然,在造型艺术上,不仅有着独特的民
气态有机物与人类生活息息相关。例如,环境保护方面,空气中低浓度的挥发性有机物给人类健康带来严重威胁,需要即时检测和控制;再如,人体呼出气体中某些有机物成分的改变,也可以作
兴化李氏家族自李春芳发迹后,其后代从事文艺创作的很多,不仅诗歌创作名家辈出,绘画也是异彩纷呈,为人们所熟知者就有“扬州八怪”之一的李鱓。其实不仅李鱓,这个家族还出了
过渡金属催化C-H键活化直接构筑C-C或C-X键,近年来得到化学家的广泛关注。该方法是一种具有避免底物预活化、原子经济性、绿色高效等优点的有机合成策略。过渡金属催化具有导向基团的C-H键活化是近几十年发展起来的一种重要的芳烃邻位C-H键选择性官能团化方法。研究表明,此类反应首先是导向基团的杂原子与金属配位,使金属与导向基团邻近的C-H键靠近、活化、形成环状金属中间体,进而进行邻位C-H键官能团化。
邓小平同志曾多次强调要对人民,特别是青年一代进行理想信念教育,并指出这是我们进行现代化建设,战胜困难和风险的重要法宝。江泽民总书记在中央思想政治工作会议上的重要讲
四川是张大千的故乡,大千先生早中期的艺术活动很大部分是在四川展开的。四川博物院作为西南地区最大的一所综合性博物馆,因缘际会,收藏了一大批张大千艺术精品。尤其是张大
锰氧化物作为传统的电极材料,广泛应用于锂锰电池、锌锰电池、碱锰电池等化学电源中。超级电容器是目前公认的实用、高效和环保的能量存储元件。锰氧化物纳米材料所形成的电极