恐怖主义犯罪是严重危害人类和平与进步的一类国际犯罪,但是面对着恐怖主义犯罪的日益猖獗,各国的反恐斗争进行的却不尽如人意,单纯的“以暴制暴”使正义的力量趋于被动。另一方面学者们在理论的层面上,对于恐怖主义犯罪的研究也明显的不够成熟。各国关于恐怖主义犯罪的法律规定由于历史背景的不同而千差万别,所以在司法上关于恐怖主义犯罪的惩治也就存在各种问题。我国在惩治恐怖主义犯罪过程中就存在着与普通犯罪的适用冲突问题,往往将不纯正的恐怖主义犯罪与普通犯罪混为一谈,本文共分为四个部分。第一章介绍了恐怖主义与恐怖主义犯罪的概念、特征和发展历史,各国关于恐怖主义犯罪的不同规定以及不纯正恐怖主义犯罪的概念。第二章区分了恐怖主义犯罪与危害国家安全罪、危害公共安全罪和危害公民人身权利犯罪。第三章重点论述了不纯正恐怖主义犯罪与普通刑事犯罪的适用冲突问题以及其成因。第四章提出了具体解决冲突的方法。面对我国恐怖主义犯罪与普通犯罪的适用冲突问题,我国应当在立法上不断完善惩治恐怖主义犯罪的相关刑事立法,同时在司法中始终贯彻罪刑法定原则和宽严相济的刑事政策；此外还要继续加强国际间的司法合作,从而才能更好地与恐怖主义犯罪作斗争。