纤毛虫是一种低等的单细胞真核生物，其主要特征是具有两种类型的细胞核:一个大核，一个或多个小核。在纤毛虫的有性生殖过程中，亲代大核发生降解，新的大核由小核合子核分裂产物之一发育而来。在小核向大核发育过程中，小核内的DNA进行一系列的程序化的基因重组，包括染色体断裂、连接、内部删除序列(Internal Eliminated Sequences，IES)的删除、基因两端端粒的附加以及基因扩增等。如何精确识别和删除IES序列，一直吸引着分子细胞生物学家们对其进行研究。本研究以纤毛虫类中具有代表性的种属——草履虫(Paramecium)、四膜虫(Tetrahymena)和游仆虫(Euplotes)中的IES序列为研究对象，通过序列统计、比对和搜索等分析，寻找纤毛虫IES序列的共同特征，为IES的起源与进化提供新的证据。　　从GenBank数据库中查找得到草履虫、四膜虫和游仆虫中含有IES的小核基因15种，其中共含有43个IES序列。对43个IES的长度、A/T含量、可能的密码子数量及边界序列进行了对比分析。分析表明每个IES中都含有终止密码子，说明IES是原始DNA序列中积累了大量点突变的结果。这样的突变使正常DNA失去了编码能力，并导致A/T平均含量达到80％，使DNA二级结构发生改变的可能性增加，这几种因素共同作用，最终导致了IES的删除现象。　　为了找到新的IES，我们克隆了八肋游仆虫(Euplotes octocorinatus)中心蛋白(Centrin)、微管蛋白(β-Tubulin)、肽链释放因子1(eRF1)和肽链释放因子3(eRF3)的小核基因，分别与相应的大核基因对比，但结果证明这4种小核基因中不含IES。　　又从八肋游仆虫大核DNA中克隆得到一种新Rab基因，该基因全长827 bp，两端为端粒序列，开放阅读框长633bp，编码210个氨基酸，在遗传密码使用上，该基因内部含有4个通用终止密码子TGA，在此编码半胱氨酸，并以TAG作为终止密码子。在NCBI上经BLAST序列比对发现，该基因拟编码的蛋白与其他物种Rab8蛋白的氨基酸序列同源性达45％～54％，具有Rab家族保守的结构特征，因此我们将它命名为Eorab8。Eorab8与其他物种的Rab8蛋白构建进化树，发现该蛋白的进化与物种的进化地位基本一致，说明该基因在细胞中可能具有重要功能。从八肋游仆虫中Eorab8小核基因也是633bp，与大核中的Eorab8的开放阅读框长度相同，证明其小核基因中不含IES。