我国流域内，由于环境保护工程对水源保护区开发的约束与流域内大规模调水，造成了流域上游和下游地区的不协调关系，引发了流域宏观和微观管理体制上的缺位等问题。 目前，国际上均是以明晰水资源产权为基础来解决水资源的利益分配问题，这种做法在我国流域的水资源补偿方面不完全适用，因为我国水资源并没有明晰区域水权，属于国家所有并统一调配。因此，适合我国流域特色的生态补偿机制亟待研究与实施。由于补偿涉及经济和生态等多学科领域，补偿金额的确定是一个难题，这也是目前的补偿机制难以很好制定的一个重要原因。 本文以上游经济落后、生态敏感，下游直接关系首都生态、社会安全的流域——潮白河流域为典型实例，探索适应社会主义市场经济规律的流域水资源管理体制和运行机制。在考察潮白河流域水资源特征及水源保护区特点的基础上，创新性地建立了潮白河流域水资源分配模型、水资源补偿定价模型、水资源定价调整模型，并利用多元回归模型，SAS等统计分析方法确定潮白河流域的具体补偿费用。论文给出了补偿机制，总体框架包括： 水资源补偿领域，初始水权分配模型，水资源补偿价值模型，模型测算方法，水资源补偿资金管理体系。论文计算结果包括分配水资源量，水资源单价，直接损失补偿金额、隐性损失补偿金额和总补偿金额。 最后，本文还提出了如下政策建议：国家应该尽快出台水资源补偿的政策，从管理体制上理顺关系，为今后研究跨流域的补偿效益计算、分配等问题作好前期准备工作。流域管理机构或政府有关职能部门，应对流域水资源补偿给予一定的重视支持或优惠政策。同时，为保障补偿制度的顺利实施，应对《物权法》、《民法》、《水法》等相关法律进行一定的修改，明确水权，建立水资源及水环境利益补偿制度，并制定相对完备的操作性与程序性规定，使操作实施得以顺利进行。