小尾寒羊无角性状的DNA标记及其差异表达基因的筛选研究

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:yy692451568
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培育无角羊品种在养羊生产中具有很多的优势。无角羊不易破坏围栏,在舍饲时占舍面积相对少,且也减少了角生长所需的营养,同时减少角斗伤残的损失,无角羊较有角羊便于管理。在澳大利亚已培育成无角陶赛特羊优良品种,无角羊已成为羊品种的发展趋势。所以,培育无角绵羊品种对畜牧业发展具有很大的意义。本实验通过分子生物学方法寻找与绵羊角相关的基因,为今后培育无角绵羊品种提供理论依据。其研究结果如下:1、微卫星标记的研究:实验以河北小尾寒羊、无角道赛特、杂种蒙古羊三个品种不同角型的羊为样本,对微卫星位点AGLA226进行扩增检测。实验共找出8个等位基因(A:190bp、B:166bp、C:184bp、D:160bp、E:180bp、F:156bp、G:175bp、H:152bp),4种基因型AB、CD、EF、GH。通过SPSS软件对实验结果进行独立性卡方检验,结果表明角型与微卫星AGLA226的关联性差异不显著(P>0.05)。2、SNPs分析:本研究利用PCR-SSCP的技术,以牛SYNJ1基因序列为引物,以三个牛品种(有角荷斯坦奶牛、无角安格斯、无角海福特牛)以及无角河北小尾寒羊、无角道赛特、杂种蒙古羊三个品种不同角型的羊DNA为模版,对SYNJ1基因进行SSCP分析及PCR产物测序。结果表明:在SNP bSYNJ1_C3981T位点上未发现多态性及与角性状相关的SNP,在牛羊物种间只存在一个C-T核苷酸差异。3、DDRT-PCR的研究:实验以有角和无角绵羊各3只为样本,分别提取总RNA。根据表型组成有角RNA池和无角RNA池。反转录后两角型的cDNA进行DDRT-PCR分析,共筛选出30条差异片段,经过二次扩增、克隆测序等方法剔除假阳性后,剩余7条差异片段。以该7条片段的测序结果设计引物,再以原RNA反转录的cDNA为模板进行扩增再进一步剔除假阳性片段,最后剩余一条差异片段S1-162。经生物信息学分析,在GenBank里分析发现该片段序列与绵羊的keratin 83(角蛋白83)的mRNA序列(1687-1842bp,非翻译区)具有100%的同源性,与牛的keratin 83的mRNA序列(1690-1835bp,非翻译区)有93%的同源性;对keratin 83的氨基酸序列进行分析,keratin 83可能通过产生异质二聚体进而形成稳定的有活性的四聚体,以及其本身的卷曲螺旋结构对角的有无起到调控作用。该基因可能是无角基因的上游调控基因,其机制有待进一步深入研究。
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