脑胶质瘤(Glioma)是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤之一，侵袭性强，容易复发，预后差，尤其胶质母细胞瘤(Glioblastoma)总生存期(OS)为16-18个月，5年生存率约为5％左右，其5年病死率仅次于胰腺癌和肺癌，位列第三。脑胶质瘤的标准治疗包括手术切除、化疗和放射治疗。治疗选择可能在疾病的不同阶段和患者的年龄方面有所不同。影响脑胶质瘤预后的因素非常复杂，包括复杂的遗传机制，如EGFR扩增，异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)，TP53突变和PTEN突变等。除此之外，能有效预测脑胶质瘤患者预后的分子生物学标志物尚知之甚少，机制也未明。因此，为了更好提高脑胶质瘤患者的生存期，并对患者预后进行有效预测，迫切需要寻找更为有效的脑胶质瘤特异性的分子生物学标记物，以便协助胶质母细胞瘤的诊断及其预后预测，从而提高其治疗效果，并进一步探究该标记物所参与的脑胶质瘤瘤发生、进展及恶化的机制，以期发现脑胶质瘤治疗新靶点。　　自噬是指细胞之中蛋白质和整个细胞器降解的生理过程。近年来，许多研究试图通过在自噬途径中进行研究来寻找新的潜在靶向治疗。此外，自噬药物可以诱导细胞自噬死亡（Ⅱ型细胞死亡）并能够引起脑胶质瘤细胞死亡。它可能成为新型脑胶质瘤治疗研究的替代和新兴概念。　　长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)为长度大于200个核苷酸，具有广泛的功能活性，而不具有蛋白质编码能力的转录物。据研究表明，长链非编码RNA可以通过多种不同的机制成为基因表达的新型调节因子。因此越来越多的证据表明，某些长链非编码RNA与癌症的发生和进展有关，并可作为癌症的生物学标志物和治疗靶点。足够的证据表明，长链非编码RNA介导自噬相关基因的转录和转录后水平，以调节自噬调节网络。本文提出利用生物信息学方法构建自噬相关长链非编码RNA的共表达网络，为脑胶质瘤的治疗提供理论依据。但由于长链非编码RNA的数量繁多，长链非编码RNA与胶质瘤发生、发展及诊断、预后之间的关系的研究仍处于起步阶段。　　目的：　　本文旨在通过生物信息学方法，筛选脑胶质瘤特异性基因及其生物学功能，探讨与自噬相关的长链非编码RNA对脑胶质瘤预后的影响，通过实验对COX10-AS1进行验证。　　方法：　　1、从中国脑胶质瘤基因组图谱中提取325例脑胶质瘤患者的信息进行生物学分析，根据2007年WHO中枢神经系统肿瘤分类标准将患者分为低级别组（WHOⅠ、Ⅱ级）和高级别组（WHOⅢ、Ⅳ级），利用中国脑胶质瘤基因组图谱全部的mRNAseq数据集通过人类自噬数据库获得长链非编码RNA和自噬基因，应用Pearson相关性分析长链非编码RNA和自噬相关基因之间的相关性。基于与预后相关的长链非编码RNA建立预后特征，将患者分为低风险和高风险组。通过单变量和多变量Cox回归分析以评估自噬相关的长链非编码RNA的预后价值，通过单变量分析将P＜0.01的长链非编码RNA包括在多变量逐步回归Cox分析中以建立风险评分。　　结果：以热图(pheatmap)、自噬基因-长链非编码RNA相互作用网络图等表示并联合基因集富集分析。利用基因集富集分析(GSEA)用于解释基因表达数据。　　2、将表达差异较为明显且尚未被过多研究的具有诊断及预后预测特性COX10-AS1作为进一步的研究对象。收集胶质母细胞患者的组织样本48例，然后用实时荧光定量PCR对COX10-AS1进行定量分析，在mRNA水平检测高级别和低级别的脑胶质瘤组织中COX10-AS1基因的表达情况以及它们之间的相关性。　　结果：　　1、通过生物信息学方法筛选出879个长链非编码RNA和216个自噬基因，并获得了402个长链非编码RNA与自噬相关的基因。本研究鉴定出10个与自噬相关的具有脑胶质瘤预后判断价值的长链非编码RNAs(PCBP1-AS1,TP53TG1,DHRS4-AS1,ZNF674-AS1,GABPB1-AS1,DDX11-AS1,SBF2-AS1,MIR4453HG,MAPKAPK5-AS1和COX10-AS1)。其中5个与自噬相关的长链非编码RNA是脑胶质瘤不利的预后因子(TP53TG1,ZNF674-AS1,COX10-AS1,DDX11-AS1和SBF2-AS1)和5个与自噬相关的长链非编码RNA被证实是脑胶质瘤的有利预后因子(PCBP1-AS1,DHRS4-AS1,GABPB1-AS1,MAPKAPK5-AS1和MIR4453HG)。脑胶质瘤高风险组的总生存时间短于低风险组[风险比(HR)=5.307，95％CI：4.195-8.305;P＜0.0001]。基因组富集分析显示，基因组在癌症相关途径中显着富集，包括白细胞介素(IL)6/Janus激酶/信号转导和转录激活因子(STAT)3，通过核因子κB的肿瘤坏死因子α信号传导，IL2/STAT5信号传导，p53途径和KRAS信号传导途径。癌症基因组图谱数据集用于验证生存率，结果显示高风险患者的总生存率明显低于低风险患者（HR=1.544，95％CI：1.110-2.231;P=0.031）。　　2、实时荧光定量PCR实验结果显示，低级别（WHOⅠ、Ⅱ级）脑胶质瘤组织中的COX10-AS1基因表达水平（1.26±0.77）显著低于高级别(Ⅲ，Ⅳ级)脑胶质瘤组织(2.13±1.77)表达水平（t=-2.214，P=0.032）。PCR验证结果与生物信息学析结果一致。　　结论：　　1、通过生物信息学对脑胶质瘤相关基因的分析，发现TP53TG1，ZNF674-AS1，COX10-AS1，DDX11-AS1和SBF2-AS15个与自噬相关的长链非编码RNA可能是脑胶质瘤不利的预后因子，而PCBP1-AS1，DHRS4-AS1，GABPB1-AS1，MAPKAPK5-AS1和MIR4453HG5个与自噬相关的长链非编码RNA可能是脑胶质瘤的有利预后因子。　　2、COX10-AS1基因mRNA表达水平与脑胶质瘤病理分级密切相关，病理级别越高，COX10-AS1基因mRNA水平越高。