白癜风及系统性红斑狼疮MHC区域精细定位研究及相关性分析

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:matrix521
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:白癜风是一种常见的色素脱失性皮肤病,主要临床表现为累及皮肤、粘膜、毛发的境界清晰的瓷白色色素脱失斑。全球发病率为0.5%-1%,各地区发病率存在较大差异。皮疹通常不伴有其他自觉症状,但由于其损容性特征及病情迁延不愈的特点,严重损害患者的心理健康及社会交往。流行病学研究证明,白癜风患者自身及一级亲属患有自身免疫性疾病(如自身免疫性甲状腺功能减退、恶性贫血、系统性红斑狼疮、Addison病及炎症性肠病等)的概率明显增加。系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus,SLE)是一种以循环系统中存在多种自体抗体为特征的结缔组织疾病,对皮肤、心脏、肾脏、神经等多个器官和系统均可产生影响。含有核酸的持续性凋亡碎片可通过激活核酸识别受体来刺激炎症反应的产生,导致SLE患者免疫失调及机体损伤。主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)是人类基因组中最具多态性的基因之一,对先天免疫和适应性免疫都有重要影响,被证明参与至多种自身免疫性疾病的发病机制中。传统GWAS研究识别出的变异多位于非编码区,无法满足对复杂疾病发病机制研究的需要,经典HLA等位基因和氨基酸多态性的基因型填充使得对MHC区域关联信号的精细定位成为可能,能够对复杂疾病的遗传学变异进行更有效的发掘。研究目的:基于中国人群特异性的HAN-MHC参考数据集及千人计划数据集,利用两种参考数据集对GWAS所获得的白癜风及SLE的MHC区域数据进行基因型填充,继而进行精细定位研究,探讨MHC区域变异在白癜风及SLE发病过程中的作用,并从遗传学角度探讨白癜风及SLE的疾病相关性。研究方法:利用Illumina 610-Quad Bead Chip芯片对1117例白癜风病例、1046例SLE病例和1693例健康对照样本进行SNP分型,随后对所获得的MHC区域GWAS数据进行基因型填充,利用相关性分析及逐步回归分析对疾病相关遗传变异进行发掘。随后对所获得的白癜风及SLE数据进行复杂性状关联分析,探究两种疾病在MHC区域的相关性。研究结果:白癜风人群中共计1776个突变达到了显著性阈值(P=1.32×10-6),包括1725个SNPs,2个CNVs,11个HLA等位基因(5个两位经典等位基因和6个四位经典等位基因),38个氨基酸位点。SLE中共计1266个突变达到显著性阈值(P=1.25×10-6),其中包括1217个SNPs,5个CNVs,5个HLA等位基因(2个两位经典等位基因和3个四位经典等位基因),39个氨基酸位点。白癜风与SLE MHC区域关联最显著的位点分别为rs113465897(P=1.03×10-13,OR=1.64,95%CI=1.44-1.87)和rs3129898(P=4.21×10-17,OR=1.93,95%CI=1.66-2.25)。逐步回归分析显示,白癜风与HLA-DQB1*0301(p=4.53×10-7,OR=0.62,95%CI=0.52-0.75)、HLA-DPB1*03:01(p=1.07×10-6,OR=1.94,95%CI=1.49-2.53),SLE与HLA-DQB1*0301(p=4.53×10-7,OR=0.62,95%CI=0.52-0.75)也具有独立的相关性。复杂性状关联分析证明两种疾病在MHC区域的相关性为0.79(P=5.99×10-10,SE=0.07),具有正相关性。结论:本研究发现了与白癜风(rs113465897,rs3130969,HLA-DPB1*03:01)和SLE(rs3129898)相关的MHC区域的新的易感信号,并证实了已报道的与SLE相关的等位基因HLA-DQB1*0301。我们揭示了白癜风和SLE的新的遗传易感性,促进了对该病的功能机制的研究,并从群体遗传学的角度论证了白癜风和SLE的相关性。
其他文献
新课改以来,广大小学数学教师在课堂上应用多样化的评价手段,显著提升了数学课堂教学质量。小学数学课堂教学中,有效的评价对于提高学生的学习效果、教师的综合素质、课堂的教学质量都有不可或缺的作用。文章以小学数学课堂教学评价的典型案例为依托,对小学数学课堂教学中有效评价的实施策略做了简要论述,旨在为课堂教学改革助力,从而实现数学课堂减负、增效、提质的目标。
初中的英语学习是学生积累词汇量的关键时期,关系着学生的词汇量数量,所以初中的英语教学方式对于学生来说是非常重要的。同时初中学生的英语单词记忆能力决定了学生是否能学好英语、是否能熟练地掌握英语句子、是否能提高自己的英语阅读能力,因此初中的英语教学是学生学习英语的基础。据调查,自从我国开始英语教学之后,就一直非常重视学生对于英语词汇量的积累,并且一直以来效果显著,因此,初中的英语教学方式中如何提升学生
课程思政、学科育德是教学的内在规定性,是落实立德树人根本任务的一道必答题,不是另加的,也不是外加的。道德教师应自觉地担当起课程思政、学科育人的重任。课程思政也是一道可解题,其丰富内涵是多方面的,主体是培育、践行社会主义核心价值观,在六个方面下功夫,尤其是加强中华优秀传统文化、革命传统文化、社会主义先进文化教育。课程思政既要坚持方向性、融入性、适宜性、生成性等原则,又要着力解决好渗透与开发、价值澄清
本文总结了美国、法国和西班牙等核电大国在核电集团公司核应急支援能力建设上的良好实践,分析了国内相关核电集团公司核应急支援能力建设现状,阐述了国家电投集团推进烟台核应急支援基地建设的原则和思路,重点总结了烟台核应急支援基地在培训能力、物资储备能力和技术支持能力建设上的主要经验,剖析了核电集团公司核应急支援能力建设中存在的主要问题,并提出了完善核电集团公司核应急支援力量建设的有关建议,希望能为有关部门
综述海关实验室在保障国门生物安全中的作用和面临的挑战。探讨了海关实验室如何在《生物安全法》指引下,加强实验室建设,以持续发挥好国门生物安全技术保障作用。
数字经济是数字技术与实体经济的深度融合,新一轮数字技术催生了商业模式、组织结构、管理方式的颠覆性变革与创新,并对会计理论与实践产生全方位、深层次的影响。数字经济的快速发展,对会计人员的知识技能和创新实践带来诸多挑战,这也使得会计人员的业务能力和综合素质需要及时更新、不断提升。培养适应数字经济发展的会计人才,是推进会计数字化转型、促进数字经济高质量发展必不可少的支撑点。本文立足于数字经济的内涵与特征
目的:通过研究按压股四头肌肌腱对缺血性脑卒中后肌痉挛(Ischemic Poststroke Myospasm,IPSS)大鼠脊髓组织环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,c AMP)、蛋白激酶A(protein kinase A,PKA)和γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)的影响,探讨按法缓解脑卒中后肌痉挛状态的机制。方法:45只
在广西西北部生活着许多少数民族,在长期的生产生活中,他们创造出了内容丰富的具有鲜明民族特色的民俗体育项目,形成广西独具特色的体育文化和对外形象标签。文章以白裤瑶族的打陀螺为例,意从历史发展角度研究与探讨桂西北少数民族民俗体育的变迁,一方面为提升桂西北少数民族民俗体育历史文化内涵,另一方面为保护和传承桂西北少数民族民俗体育项目提供历史资料。文章呼吁政府加强宣传推广工作,促进桂西北少数民族民俗体育文化
2019年超强台风"利奇马"是历史上少有的超强台风。但与历史上类似台风相比,该台风造成的灾害伤亡和损失大大减少。其应对过程具有几个突出特点:指导思想明确、政治领导到位,央省两级带动各地高位推动和统筹联动,预报预警和防范救援精准高效。此次风灾应对表明,我国自然灾害应对领域已经形成了有效的中国特色公共安全保障体系。
由于天线近场辐射特性较为复杂,目前国内尚无统一的电磁环境辐射测试及评价标准。文章研究移动通信基站的电磁辐射安全问题,分析天线近场区电磁辐射功率随着相对天线的距离和角度的改变而变化的规律。研究结果表明,无论是在垂直面还是在水平面,只要测量位置在天线方向图主波束的半功率波束宽度内,天线辐射场功率密度值始终存在远场公式计算值大于近场辐射仿真值,因此可以用远场计算值保守估计实际天线的近场辐射功率密度值。研