白刺属(Nitraria L.)是蒺藜科(Zygophyllaceae)的一个古老小属。在内蒙古西部白刺自然分布区内,大多数地区存在齿叶白刺(Nitraria roborowskii)和唐古特白刺(N.tangutorum)大范围的重叠分布。在这些区域内,许多植株形态差异呈现连续过渡性变异,单纯依靠形态学方法无法界定其类别。本文结合ISSR分子标记和trnL-F、rDNA ITS序列分析方法,对齿叶白刺、唐古特白刺以及疑似杂交个体共55个个体进行了分析,以期探明内蒙古地区分布的白刺属植物物种间的连续变异是否由于广泛杂交或较强的基因渐渗引起的。该项研究不仅有助于更深入地理解物种的形成和进化机制,而且对探明我国白刺属植物的物种分化进程和种质资源的保存利用有着十分重要的意义。主要研究结果如下：1、采用正交拉丁方试验设计优化,获得了适合于白刺属植物的ISSR反应体系。2、11个引物在55个个体中共检测到95条扩增片段,其中多态性条带为92条,多态性条带百分率为96.84%。遗传多样性指标为杂交群体(0.4633±0.2067)>齿叶白刺(0.3576±0.2762)>唐古特白刺(0.3477±0.2925)。3个群体遗传分化系数Gst为0.2589,基因流高达1.4315,Nm值大于1,说明群体间分化很小,群体间基因流强度较大。群体间的平均杂合度Ht大于群体内的杂合度Hs,推测齿叶白刺和唐古特白刺存在渐渗杂交现象。3、根据Nei’s基因多样度与Shannon多样性指数,在群体水平上多样度表现为杂交群>齿叶白刺>唐古特白刺,与多态位点百分率的顺序相同。说明杂交群具有较高的遗传多样性。4、所有种群的聚类分析显示,杂交群的5个种群构成的一大支首先与齿叶白刺6个种群构成的大支相聚,然后再与唐古特白刺5个种群的大支聚到一起,表现出杂交群与齿叶白刺关系更为密切。5、根据叶绿体DNA直接测序的结果,在两个亲本种的15个差异位点上,杂交个体在其中73,3%的位点上与齿叶白刺相同,26.7%的位点与唐古特白刺相同。6、对ITS直接测序的研究结果发现：在两个亲本种的碱基替换位点上,杂交个体在其中37.5%的位点上为粘合性重叠,25%的位点与齿叶白刺相同,37.5%的位点与唐古特白刺相同。结果表明中间形态个体是齿叶白刺和唐古特白刺的渐渗杂交后代。