深化收入分配制度改革，完善事业单位工资制度，建立健全符合事业单位特点、体现岗位绩效和分级分类管理的工资分配制度，是党中央、国务院对事业单位改革提出的新要求。基层医疗卫生机构作为卫生系统的重要组成部分，关系到人们群众的日常生活和身体健康，越来越受到各方面的重视。如何提高基层医疗卫生机构的服务质量，体现基层医疗卫生机构的公益性，调动基层医疗卫生机构工作人员的工作积极性，关键看基层医疗卫生机构绩效工资开展情况。本文正是适应事业单位绩效工资改革的需要，以沈阳市基层医疗卫生机构为研究对象，通过对我市基层医疗工作者相关的问卷调查，阐明当前我市基层医疗卫生机构绩效工资改革的现状。深刻剖析其存在的问题和难点，归纳其产生的原因主要有以下几方面：一是政策不配套，政策依据不足；二是认识不到位，阻碍了改革的发展；三是缺乏科学客观的绩效考评机制。这些问题严重影响着基层医务工作者的积极性，影响基层医疗卫生机构的健康发展。紧接着本文针对这些问题明确我市基层医疗卫生机构改革的总体思路和主要目标，为当前基层医疗卫生机构设计绩效工资方案，从而完善我市基层医疗卫生机构工资分配体系，构建科学合理的考核指标体系，严格考核程序，减少绩效工资中的不合理因素，保证绩效工资分配的公平性，激励员工努力工作，进而提高基层医疗卫生机构的整体工作效率，为推动我市基层医疗卫生绩效改革的理论研究和实践提供一定的参考和借鉴。