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中国西北黄土高原农业粮食生产区因干旱贫瘠而广受关注。如何提高作物产量,同时维持土壤肥力和土壤质量成为这一区域农业发展的关键问题。为此,平凉农科所于1979年建立了高平村长期定位实验站,用来评估长期不同施肥效应和小麦-玉米轮作制度对干旱区农业生产力的影响,以期探究土壤生态系统功能对农业管理的响应。实验包括6个处理:N(单施氮肥)、NP(氮磷并施)、SNP(秸秆与氮磷合施)、M(单施厩肥)、MNP(厩肥与氮磷并施)、和CK(无肥对照)。尽管已有报道表明长期不同施肥对该实验地作物产量影响很大,然而,还没有土壤微生物的相关报道,虽然它们与土壤肥力和植物健康密切相关。为了解长期不同施肥对该地区土壤微生物的影响,我们以不同生长期小麦根际土壤总细菌和部分功能菌群:氨氧化细菌(AOB)、假单胞杆菌(Pseudomonas)、及丛枝菌根真菌(AMF)为研究对象,采取PCR及变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,并结合克隆测序方法分析不同菌群对长期施肥和作物生长期的响应。同时对群落物种组成和土壤理化因子进行CCA分析,以期找出影响该地区微生物群落结构和功能的主要生态因子。结果表明:长期施肥对土壤肥力和微生物结构有很大影响。平衡施肥(MNP)显著提高了土壤肥力水平,而无肥处理土壤肥力最低。同时,MNP和M肥力水平相近,NP和SNP相近,CK和N相近。基于PCR-DGGE凝胶回收条带克隆测序的群落分析表明:多数细菌属于拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria);厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、芽孢杆菌门(Gemmatimonadetes)中细菌成员也占有一定比例。优势类群与克雷伯氏菌属中(Klebsiella.sp)和戴尔福特菌(Delftia tsuruhatensis)极为类似。基于AOB的amoA基因的系统发生表明:亚硝化螺菌属(Nitrosospira)第3进化支(cluster-3)在该地区为优势类群。有趣的是,多数序列的参考序列来自对我国施肥样地的研究。假单胞菌菌落分析表明:施加有机肥(M或S),有利于部分假单胞菌群落丰度的增加,主要分子种与Pseudomonas fluorescens,Pseudomonas putida等假单胞菌群中最常见物种类似。然而,AMF多样性在本研究样地较低,仅出现了6个分子种,均属于球囊霉菌(Glomus)。极具优势物种序列与摩西球囊霉菌18S部分序列极为相似。CCA分析表明土壤总细菌和AOB群落结构在不同处理下变化明显。但AMF群落对不同施肥处理制度的响应不敏感。与CK相比,施肥(M、S或N、P)有益于土壤微生物多样性的提高。不同处理下小麦产量在1732 kg ha-1(CK)到5620 kg ha-1(MNP)间变化,单因素方差分析表明:MNP和NP、SNP间没有显著差异,但与M、N、CK间差异极其显著(P<0.01)。总之,我们可以得出以下结论:(1):长期不同施肥对土壤肥力水平影响很大,尤其是长期施加厩肥。(2):土壤总细菌和AOB群落结构对不同施肥制度响应明显,细菌分子种丰度随生长季下降明显。AMF和假单胞菌受长期施肥影响较小,但施肥后,特异物种丰度会发生明显改变。(3):土壤湿度和pH对该地区土壤微生物群落组成的影响最大,土壤有机碳、总碳和土壤总氮的作用次之。(4):小麦产量对不同施肥处理响应明显。平衡施肥(MNP)对该地区粮食安全和农业生态系统稳定有重要作用。因此,在今后研究中可选择更多具有指示作用的功能群落。更为有力的统计工具的选择将有利于获得可靠的结果,并更好地联系微生物群落结构和生态系统功能。