“十三五”规划提出了绿色发展理念,指出要转变传统生产方式,重视经济的可持续发展。当前,中国产业结构不合理、产能过剩和环境污染问题依然突出,产业结构调整及转型处于关键时期。由于产业结构升级主要包括产业结构合理化和产业结构高级化,同时第二产业相较于第一、第三产业,TFP、能源消耗和污染程度都较大,因此本文从合理化和高级化两个维度,三次产业以及制造业两个层次,来研究产业结构升级如何作用于绿色全要素生产率。这对探讨产业结构升级的方向,促进我国绿色经济的发展有重要意义。本文首先梳理了产业结构升级相关理论、绿色全要素生产率的测度方法以及产业结构升级对绿色全要素生产率影响的现有研究,发现在研究产业结构升级对绿色全要素生产率的影响时大都只从高级化角度衡量产业结构升级,而忽视了产业结构合理化的影响。因此,本文从合理化和高级化两个维度,基于要素能否充分自由流动,得出产业结构升级对绿色全要素生产率的作用机制:（1）当要素可以充分自由流动时,产业结构合理化和高级化的变化方向是一致的,可以促进绿色全要素生产率的增长;（2）当要素由于行业壁垒、制度约束等因素导致不能充分自由流动时,二者的变动趋势可能不一致,对绿色全要素生产率增长的作用方向可能不同。在实证部分,本文首先测算了省际绿色全要素生产率指数、三次产业以及制造业结构的合理化和高级化指数;其次,根据相关检验确定本文应采用空间杜宾模型进行实证分析;接着,为了进一步分析产业结构升级对绿色全要素生产率影响的直接效应和空间溢出效应,对空间杜宾模型的估计结果进行效应分解,得到以下主要结论:（1）对于三次产业结构升级而言,合理化通过直接效应和间接效应促进绿色全要素生产率的增长,然而以经济服务化表征的高级化对绿色全要素生产率的促进作用并不显著。这主要是因为三次产业结构合理化通过要素重置效应、结构协调效应以及技术进步效应产生双重正面效应,而当前我国高端服务业发展不足,第三产业整体的TFP不高。（2）对于制造业结构升级而言,高级化主要通过直接效应促进绿色全要素生产率的增长,而合理化对绿色全要素生产率的增长没有显著的促进作用。这主要是因为高端技术制造业拥有高技术、高附加值、低污染能耗,而中低端技术制造业缺乏核心技术,能耗和环境污染严重,在全球价值链分工体系中的地位仍然较低。此外,本文还发现贸易开放和经济发展水平显著促进绿色全要素生产率增长,外商直接投资对绿色全要素生产率表现为抑制作用,政府干预对绿色全要素生产率的促进作用不显著。最后,根据实证分析结果提出相关政策建议。