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石斛(Dendrobium)是兰科最大属之一,川滇地区占我国资源总数85%左右,且石斛在理论研究、观赏、药用方面都有巨大价值,因此有必要对川滇地区石斛资源多样性及其遗传背景开展研究,为川滇地区石斛资源的开发利用及其深入研究提供参考。因此通过对石斛植物开展资源收集与栽培管理,调查统计形态差异,计算变异系数(CV),采用分光光度计(UV-Vis)、高效液相色谱(HPLC)、高效阴离子交换色谱(HPAEC)等技术手段进行含量检测和质量检验手段的建立,对不同石斛植物的化学成分进行差异比较,最后通过ISSR分子标记研究其遗传背景,总结实验结果得到以下结论。1、调查统计21种石斛植株长度、茎节数、节长、叶片数、叶长、叶宽6个性状,计算CV值分别为53.33%、69.39%、48.71%、55.70%、51.62%、61.99%,表明石斛的形态变异丰富,在形态上具有丰富的多样性。2、建立的HPAEC和HPLC检测方法能对《中国药典2015版》规定检测项甘露糖、毛兰素、石斛酚类等物质实现快速、高效的检测检验,同时还能对石斛中单糖组分(主要包括无水葡萄糖、鼠李糖、阿拉伯糖、木糖、果糖、乳糖)和其它化学成分(丁香酸、柚皮素、槲皮素、香豆素、没食子酸、香草醛)进行有效测定,建立的石斛化学成分检测检验方法能够为石斛质量控制提供一定的参考价值。3、通过化学成分分析表明这21种石斛在水分含量、多糖含量上差异显著,在单糖和其它化学成分组成和含量上也是差异明显,从化学成分上可以看出此次收集的石斛植物在化学成分上的多样性;通过相似性分析,对比药典品种,此次收集的非药典种质中麝香石斛和长距石斛是值得关注的种质资源。通过PCA不同算法分析,不同的算法得到的化学成分聚类结果存在差异,但也能起到化学成分聚类鉴定的作用。4、ISSR分子标记共筛选出9条引物UBC811、UBC819、UBC835、UBC844、UBC855、UBC884、UBC886、UBC889、UBC890,一共扩增出626条条带,多态性条带571条,多态性比率为91.3%;在遗传相似系数为0.3时能将其分为6类,第一类包含尖刀唇石斛、小黄花石斛、景洪石斛和铁皮石斛4种石斛;第二类包含麝香石斛、蜻蜓石斛、细茎石斛、金钗石斛、黄喉石斛、玫瑰石斛、苏瓣石斛、叠鞘石斛8种石斛;第三类包含长苏石斛和姬竹叶石斛2种;第四类包含卵叶贝母兰和球花石斛2种;第五类包含紫婉石斛、喇叭唇石斛、鼓槌石斛和滇金石斛4种;第六类包含长距石斛1种。